SHARPIN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SHARPIN是线性泛素化复合物的重要组分,参与NF-κB信号通路调控,其突变与慢性增殖性皮炎及多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SHARPIN |
|---|---|
| 基因全名 | SHARPIN, 线性泛素化复合物亚基(SHARPIN, linear ubiquitination complex subunit) |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 12q24.33 |
| NCBI Gene ID | 81858 ncbi.nlm.nih.gov/gene/81858 |
| Ensembl ID | ENSG00000179526 |
| UniProt ID | Q9H0F6 |
| OMIM ID | 611884 |
| HGNC ID | 25321 |
| 基因别名 | SHARPIN, hSharpin, SIPL1, 4933407L14Rik |
基因功能与研究简介
SHARPIN基因编码SHARPIN蛋白,是线性泛素化复合物(LUBAC)的组成亚基之一。LUBAC由HOIP、HOIL-1L和SHARPIN组成,负责生成线性(M1连接的)多聚泛素链,在NF-κB信号通路、炎症反应和细胞凋亡调控中发挥关键作用。SHARPIN通过其UBL结构域与HOIP相互作用,稳定LUBAC复合物并促进其催化活性。SHARPIN功能缺失会导致NF-κB信号受损,影响免疫应答和细胞存活。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 慢性增殖性皮炎(Chronic Proliferative Dermatitis) | SHARPIN基因突变导致LUBAC功能缺失,NF-κB信号受损,引发皮肤炎症和增殖异常。 | 已明确致病(小鼠模型和人类病例) |
| 肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma) | SHARPIN表达异常与肝癌发生相关,可能通过调控NF-κB和细胞凋亡影响肿瘤进展。 | 具有较强研究证据 |
| 乳腺癌(Breast Cancer) | SHARPIN在乳腺癌中表达上调,可能促进肿瘤细胞增殖和转移。 | 具有较强研究证据 |
| 前列腺癌(Prostate Cancer) | SHARPIN表达与前列腺癌进展相关,可能通过NF-κB通路影响肿瘤生长。 | 潜在关联 |
| 自身免疫性疾病(Autoimmune Diseases) | SHARPIN参与调控免疫应答,其变异可能与自身免疫性疾病风险相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| LNCaP | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.346C>T (p.Arg116*) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.497G>A (p.Trp166*) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1114C>T (p.Arg372*) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1183C>T (p.Arg395*) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SHARPIN功能缺失突变(如无义突变)导致LUBAC复合物活性降低或丧失,影响NF-κB信号通路,与慢性增殖性皮炎等疾病相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SHARPIN存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SHARPIN突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0005829 cytosol | • GO:0005654 nucleoplasm |
| • GO:0007249 I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling | • GO:0043123 positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling |
| • GO:0006915 apoptotic process | • GO:0006954 inflammatory response |
相关通路
• NF-kappaB signaling pathway (KEGG: hsa04064)
• TNF signaling pathway (KEGG: hsa04668)
• IL-17 signaling pathway (KEGG: hsa04657)
蛋白质功能简介
SHARPIN蛋白(UniProt Q9H0F6)由387个氨基酸组成,包含N端的UBL结构域和C端的NZF结构域。作为LUBAC复合物的亚基,SHARPIN通过UBL结构域与HOIP相互作用,稳定复合物并促进线性泛素化。SHARPIN参与调控NF-κB信号通路、细胞凋亡和炎症反应。其表达异常与多种疾病相关,包括慢性增殖性皮炎和癌症。