SHISA4基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
SHISA4是Wnt信号通路和FGF信号通路的调控因子,参与神经发育和细胞分化,其异常表达与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SHISA4 |
|---|---|
| 基因全名 | shisa family member 4 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q32.1 |
| NCBI Gene ID | 149345 ncbi.nlm.nih.gov/gene/149345 |
| Ensembl ID | ENSG00000116774 |
| UniProt ID | Q8N114 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:26533 |
| 基因别名 | FLJ14490, MGC126851, MGC126853 |
基因功能与研究简介
SHISA4基因编码一个含有半胱氨酸-rich结构域的跨膜蛋白,属于SHISA家族。该蛋白定位于内质网,通过抑制Wnt和FGF信号通路的配体成熟和分泌,负向调控这些信号通路。SHISA4在神经发育、细胞分化和癌症中发挥重要作用。研究表明,SHISA4在多种肿瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | SHISA4表达下调,可能通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤进展 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | SHISA4表达下调,与不良预后相关,可能通过调控Wnt信号通路影响肿瘤发生 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | SHISA4表达下调,可能参与肿瘤发生发展 | 潜在关联 |
| 神经发育异常 | SHISA4在神经发育中发挥作用,但具体疾病关联尚不明确 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
| c.100C>T (p.Arg34Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SHISA4功能丧失突变可能解除对Wnt和FGF信号通路的抑制,导致信号过度激活,促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SHISA4存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SHISA4突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0007165 (signal transduction) | • GO:0016055 (Wnt signaling pathway) |
| • GO:0008543 (fibroblast growth factor receptor signaling pathway) |
相关通路
• Wnt signaling pathway (P00057)
• FGF signaling pathway (P00021)
蛋白质功能简介
SHISA4蛋白是一种内质网驻留的跨膜蛋白,包含一个N端信号肽、一个半胱氨酸-rich结构域和一个跨膜结构域。它通过结合Wnt和FGF配体,阻止其成熟和分泌,从而负向调控这些信号通路。SHISA4在神经发育中调节细胞分化,在多种癌症中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。