SHLD1基因|基因功能、疾病关联、突变与DNA修复研究

SHLD1是Shieldin复合物的关键组分,参与DNA双链断裂的末端切除调控,对同源重组修复和化疗耐药具有重要影响。

基因信息卡

基因符号 SHLD1
基因全名 shieldin complex subunit 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 20p13
NCBI Gene ID 100506658 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100506658
Ensembl ID ENSG00000273170
UniProt ID A0A1W2PRU5
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:53823
基因别名 C20orf196, FLJ46257

基因功能与研究简介

SHLD1(Shieldin复合物亚基1)是Shieldin复合物的核心组分,该复合物包括SHLD1、SHLD2、SHLD3和REV7,在DNA双链断裂(DSB)修复中发挥关键作用。SHLD1通过与SHLD2和REV7相互作用,抑制BRCA1缺陷细胞中DNA末端切除,从而促进非同源末端连接(NHEJ)并抑制同源重组(HR)。SHLD1的异常表达或突变与肿瘤发生及化疗耐药相关,尤其在BRCA1/2缺陷型癌症中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 SHLD1突变可能影响DNA修复功能,增加基因组不稳定性,与乳腺癌风险相关(研究证据较强) ClinVar, COSMIC
卵巢癌 SHLD1表达异常与BRCA1/2缺陷型卵巢癌的化疗耐药相关(研究证据较强) COSMIC, PubMed
其他癌症 SHLD1在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生(潜在关联) COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或相互作用
c.456delC (p.Pro152LeufsTer23) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
c.789G>A (p.Trp263Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码或无义突变,导致SHLD1蛋白截短或缺失,破坏Shieldin复合物功能,影响DNA修复。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SHLD1存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SHLD1存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006281 (DNA repair)
• GO:0006302 (double-strand break repair) • GO:0006303 (double-strand break repair via nonhomologous end joining)
• GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination)

相关通路

Homologous recombination (hsa03440)
Non-homologous end-joining (hsa03450)

蛋白质功能简介

SHLD1蛋白是Shieldin复合物的亚基,该复合物在DNA双链断裂修复中起关键作用。SHLD1通过其C端结构域与SHLD2和REV7相互作用,抑制BRCA1缺陷细胞中DNA末端切除,从而促进NHEJ并抑制HR。SHLD1的缺失或突变会导致DNA修复缺陷,增加基因组不稳定性,与肿瘤发生和化疗耐药相关。

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