SHLD3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SHLD3是DNA双链断裂修复通路中的重要因子,参与维持基因组稳定性,其功能异常与癌症等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SHLD3 |
|---|---|
| 基因全名 | shieldin complex subunit 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q35.3 |
| NCBI Gene ID | 100289187 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100289187 |
| Ensembl ID | ENSG00000275126 |
| UniProt ID | A0A1W2PRU4 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:53822 |
| 基因别名 | C5orf36, FLJ46257 |
基因功能与研究简介
SHLD3(shieldin complex subunit 3)是shieldin复合物的一个亚基,该复合物在DNA双链断裂修复中发挥关键作用,特别是在非同源末端连接(NHEJ)途径中。SHLD3通过与SHLD1、SHLD2和REV7等蛋白相互作用,参与调控DNA修复过程,维持基因组稳定性。研究表明,SHLD3功能缺失可能导致DNA修复缺陷,增加基因组不稳定性,与癌症等疾病的发生发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | SHLD3功能缺失可能导致DNA修复缺陷,增加基因组不稳定性,与癌症发生相关。 | 较强研究证据 |
| 免疫缺陷 | SHLD3参与DNA修复,其缺陷可能影响免疫细胞发育,但具体关联尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.456delC (p.Pro152LeufsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能引起功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能破坏SHLD3在DNA修复中的功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0006281 (DNA repair) |
| • GO:0006303 (double-strand break repair via nonhomologous end joining) |
相关通路
• Non-homologous end joining (NHEJ) pathway (Reactome: R-HSA-5693567)
蛋白质功能简介
SHLD3蛋白是shieldin复合物的亚基,该复合物在DNA双链断裂修复中发挥作用。SHLD3包含一个C端结构域,可能参与蛋白相互作用。其具体分子功能尚在研究中,但已知其参与NHEJ途径,影响DNA修复效率。