SHPRH基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SHPRH（SNF2组蛋白接头PHD指蛋白RING解旋酶）是一种参与DNA损伤修复和基因组稳定性维持的关键蛋白，其突变与多种癌症风险相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SHPRH |
|---|---|
| 基因全名 | SNF2 histone linker PHD finger RING helicase |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 6q24.3 |
| NCBI Gene ID | 25797 ncbi.nlm.nih.gov/gene/25797 |
| Ensembl ID | ENSG00000053747 |
| UniProt ID | Q149N8 |
| OMIM ID | 612277 |
| HGNC ID | 29310 |
| 基因别名 | bA145L22.2, C6orf38, FLJ21908, KIAA1622 |
基因功能与研究简介
SHPRH基因编码一种SNF2家族DNA解旋酶，包含PHD指和RING指结构域。该蛋白参与DNA损伤修复，特别是通过泛素化途径调控PCNA的修复功能，维持基因组稳定性。SHPRH功能缺失与多种癌症的发生发展相关，包括黑色素瘤、肺癌和乳腺癌等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 黑色素瘤 | SHPRH突变导致DNA修复缺陷，增加基因组不稳定性，促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | SHPRH表达下调与肺癌进展相关，可能通过影响DNA修复和细胞周期调控。 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | SHPRH突变或表达异常与乳腺癌风险增加有关。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | SHPRH基因多态性可能与结直肠癌易感性相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2785C>T (p.Arg929Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function，导致截短蛋白，功能丧失 |
| c.2146A>G (p.Thr716Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能，需进一步研究 |
| c.3457G>A (p.Val1153Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能，需进一步研究 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
Loss of Function（功能丧失型）：SHPRH突变导致蛋白功能缺失，影响DNA修复，增加基因组不稳定性。
Gain of Function（功能获得，GOF）
Gain of Function（功能获得型）：目前暂无明确证据表明SHPRH存在功能获得型突变。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
Dominant Negative（显性负效）：目前暂无明确证据表明SHPRH突变具有显性负效作用。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005524 (ATP binding) | • GO:0004386 (helicase activity) |
| • GO:0006281 (DNA repair) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• hsa03440 (Homologous recombination)
• hsa03420 (Nucleotide excision repair)
• hsa04120 (Ubiquitin mediated proteolysis)
蛋白质功能简介
SHPRH蛋白属于SNF2家族，具有ATP依赖的解旋酶活性，参与DNA损伤修复。它通过泛素化PCNA调控修复途径，维持基因组稳定性。SHPRH在多种组织中表达，其功能异常与癌症发生相关。
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