SHROOM4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SHROOM4基因编码肌动蛋白结合蛋白,参与细胞骨架调控,与神经发育障碍和X连锁智力障碍相关。

基因信息卡

基因符号 SHROOM4
基因全名 shroom family member 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xp11.22
NCBI Gene ID 57477 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57477
Ensembl ID ENSG00000158352
UniProt ID Q9ULL8
OMIM ID 300579
HGNC ID 29215
基因别名 KIAA1202, SHROOM4, MGC131851

基因功能与研究简介

SHROOM4基因编码Shroom家族成员4蛋白,该蛋白含有PDZ结构域和ASD2结构域,参与调控肌动蛋白细胞骨架的组织和细胞形态发生。SHROOM4在神经系统中高表达,对神经管闭合和神经元形态发生至关重要。SHROOM4基因突变与X连锁智力障碍、小头畸形和癫痫等神经发育障碍相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
X连锁智力障碍 SHROOM4基因突变导致蛋白功能异常,影响神经元形态发生和突触形成,导致智力障碍。 已明确致病
小头畸形 SHROOM4突变影响神经管闭合和脑发育,导致小头畸形。 已明确致病
癫痫 SHROOM4突变可能影响神经元兴奋性,增加癫痫风险。 具有较强研究证据
自闭症谱系障碍 SHROOM4突变与自闭症相关,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.214C>T (p.Arg72Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1000delA (p.Thr334ProfsTer23) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.1501G>A (p.Gly501Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致蛋白截短或降解,功能丧失,是SHROOM4相关疾病的主要机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003779 (actin binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005886 (plasma membrane) • GO:0030036 (actin cytoskeleton organization)
• GO:0000902 (cell morphogenesis)

相关通路

Regulation of actin cytoskeleton (KEGG: hsa04810)
Axon guidance (KEGG: hsa04360)

蛋白质功能简介

SHROOM4蛋白属于Shroom家族,含有PDZ结构域和ASD2结构域,通过结合肌动蛋白和肌球蛋白II调控细胞骨架重塑。在神经发育中,SHROOM4参与神经管闭合和神经元形态发生,其功能异常可导致神经发育障碍。

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