SIAH1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SIAH1编码E3泛素连接酶,参与泛素-蛋白酶体途径,调控细胞凋亡、肿瘤抑制及多种信号通路,与癌症和神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SIAH1 |
|---|---|
| 基因全名 | siah E3 ubiquitin protein ligase 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16q12.1 |
| NCBI Gene ID | 6477 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6477 |
| Ensembl ID | ENSG00000196502 |
| UniProt ID | Q8IUQ4 |
| OMIM ID | 602212 |
| HGNC ID | 10857 |
| 基因别名 | SIAH-1; SIAH1A; hSIAH1 |
基因功能与研究简介
SIAH1(siah E3 ubiquitin protein ligase 1)基因编码一种E3泛素连接酶,属于SIAH家族。该蛋白通过泛素-蛋白酶体途径介导多种底物的降解,参与调控细胞凋亡、细胞周期、缺氧应答、Wnt信号通路等。SIAH1在多种肿瘤中表达下调,被认为是一种肿瘤抑制因子。此外,SIAH1还参与神经退行性疾病(如帕金森病)的病理过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | SIAH1在多种肿瘤中表达下调,可能通过降解β-catenin等促癌蛋白抑制肿瘤发生发展。 | 较强研究证据 |
| 帕金森病 | SIAH1与帕金森病相关蛋白(如α-synuclein)相互作用,可能参与其降解或聚集。 | 潜在关联 |
| 亨廷顿病 | SIAH1可能参与突变亨廷顿蛋白的降解,影响疾病进展。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.421C>T (p.Arg141Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.574A>G (p.Thr192Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或底物结合 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如无义突变导致蛋白截短,可能降低E3连接酶活性,影响底物降解。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
相关通路
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
• Wnt signaling pathway (KEGG: hsa04310)
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)
蛋白质功能简介
SIAH1蛋白是一种E3泛素连接酶,包含RING finger结构域和底物结合结构域。它通过泛素化多种底物(如β-catenin、DCC、HIPK2等)参与调控细胞凋亡、细胞周期和肿瘤抑制。SIAH1在缺氧条件下表达上调,并通过降解脯氨酰羟化酶(PHD)参与缺氧应答。此外,SIAH1与神经退行性疾病相关蛋白相互作用,可能影响其降解和聚集。