SIAH3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SIAH3是E3泛素连接酶SIAH家族成员,参与泛素-蛋白酶体途径,调控细胞凋亡、细胞周期和DNA损伤应答,与多种癌症和神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SIAH3 |
|---|---|
| 基因全名 | siah E3 ubiquitin protein ligase family member 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 13q14.13 |
| NCBI Gene ID | 164668 ncbi.nlm.nih.gov/gene/164668 |
| Ensembl ID | ENSG00000102547 |
| UniProt ID | Q8N3C0 |
| OMIM ID | 614183 |
| HGNC ID | 26942 |
| 基因别名 | SIAH-3, siah-1 interacting protein |
基因功能与研究简介
SIAH3(siah E3 ubiquitin protein ligase family member 3)是SIAH家族的一员,编码一种E3泛素连接酶。该蛋白参与泛素-蛋白酶体途径,调控多种底物的降解,从而影响细胞凋亡、细胞周期、DNA损伤应答和缺氧反应等关键生物学过程。SIAH3在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,SIAH3可能作为肿瘤抑制因子,在多种癌症中表达下调或突变,与肿瘤发生发展相关。此外,SIAH3还参与神经退行性疾病的病理过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | SIAH3在多种癌症中表达下调或突变,可能通过影响p53等底物的降解参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 神经退行性疾病 | SIAH3可能参与帕金森病等神经退行性疾病的病理过程,通过泛素化α-突触核蛋白等蛋白。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.457C>T (p.Arg153Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.112A>G (p.Thr38Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变导致截短蛋白,丧失E3连接酶活性,可能影响底物降解。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005829 (cytosol) |
| • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
| • GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus) |
相关通路
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)
蛋白质功能简介
SIAH3蛋白属于RING-type E3泛素连接酶家族,包含RING finger结构域和SIAH-type结构域。它通过泛素化底物蛋白(如p53、β-catenin等)参与调控细胞凋亡、细胞周期和DNA损伤应答。SIAH3在多种肿瘤中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。此外,SIAH3还参与神经退行性疾病的病理过程。