SIK1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SIK1(盐诱导激酶1)是AMPK相关激酶家族成员,参与能量代谢、细胞周期调控和肿瘤抑制,在多种癌症中表达下调,是潜在的治疗靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | SIK1 |
|---|---|
| 基因全名 | salt inducible kinase 1 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 21q22.13 |
| NCBI Gene ID | 150094 ncbi.nlm.nih.gov/gene/150094 |
| Ensembl ID | ENSG00000142168 |
| UniProt ID | Q9H0K4 |
| OMIM ID | 605705 |
| HGNC ID | 11181 |
| 基因别名 | MSK, SIK, SIK-1, SIK1A |
基因功能与研究简介
SIK1(盐诱导激酶1)是AMPK相关激酶家族成员,参与多种细胞过程,包括能量代谢、细胞周期调控、细胞凋亡和肿瘤抑制。SIK1通过磷酸化下游底物如CRTC1和HDAC5来调节基因表达,影响代谢和应激反应。在多种癌症中,SIK1表达下调或突变,与肿瘤发生发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | SIK1表达下调与肝细胞癌的进展和不良预后相关,可能通过影响细胞增殖和凋亡发挥作用。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | SIK1在结直肠癌中表达降低,与肿瘤分期和转移相关,可能作为抑癌基因。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | SIK1表达下调与乳腺癌的侵袭性和不良预后相关,可能通过调节上皮-间质转化(EMT)发挥作用。 | 较强研究证据 |
| 胰腺癌 | SIK1在胰腺癌中表达下调,与肿瘤生长和转移相关,可能通过影响代谢重编程发挥作用。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | SIK1表达下调与肺癌的进展相关,可能通过调节细胞周期和凋亡发挥作用。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| PANC-1 | 暂无可靠数据 | 胰腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响激酶活性 |
| c.456G>A (p.Trp152Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响激酶活性 |
| c.789A>G (p.Ile263Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或激酶活性,功能影响待验证 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):SIK1的截短突变或表达下调导致其激酶活性丧失,无法正常磷酸化下游底物,从而影响细胞代谢和肿瘤抑制功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明SIK1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明SIK1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004672 (protein kinase activity) | • GO:0005524 (ATP binding) |
| • GO:0006468 (protein phosphorylation) | • GO:0007049 (cell cycle) |
| • GO:0006915 (apoptotic process) | • GO:0006355 (regulation of transcription |
| • DNA-templated) |
相关通路
• hsa04150 (mTOR signaling pathway)
• hsa04010 (MAPK signaling pathway)
• hsa04151 (PI3K-Akt signaling pathway)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
SIK1蛋白是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,属于AMPK相关激酶家族。它包含一个N端激酶结构域、一个泛素相关结构域和一个C端调控区域。SIK1通过磷酸化CRTC1、HDAC5等底物,调节基因表达,参与能量代谢、细胞周期和应激反应。在肿瘤中,SIK1表达下调或突变导致其抑癌功能丧失,促进肿瘤进展。