SIM1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SIM1基因编码转录因子,参与下丘脑发育和能量代谢调控,与肥胖和神经内分泌疾病密切相关。

基因信息卡

基因符号 SIM1
基因全名 single-minded family bHLH transcription factor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 6q16.3
NCBI Gene ID 6492 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6492
Ensembl ID ENSG00000112290
UniProt ID P81133
OMIM ID 603128
HGNC ID 10882
基因别名 bHLHe14, SIM, SIM1, single-minded homolog 1

基因功能与研究简介

SIM1基因编码一种基本的螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子,属于PAS(Per-Arnt-Sim)家族。SIM1蛋白在发育过程中参与中枢神经系统的模式形成,特别是下丘脑的发育。在成体中,SIM1在下丘脑的特定核团中表达,调节能量平衡、摄食行为和自主神经功能。SIM1功能缺失或突变与肥胖、食欲亢进和神经内分泌异常相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肥胖 SIM1基因突变导致单基因肥胖,通过影响下丘脑食欲调节通路,导致食欲亢进和能量代谢失衡。 已明确致病
Prader-Willi综合征 SIM1基因位于6q16.3,该区域缺失与Prader-Willi综合征相关,但SIM1单独缺失不足以引起全部症状,可能与其他基因共同作用。 具有较强研究证据
神经内分泌功能障碍 SIM1突变可能影响下丘脑-垂体轴,导致生长激素缺乏、性腺功能减退等。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
下丘脑 暂无可靠数据 高表达
脂肪组织 暂无可靠数据 低表达
骨骼肌 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.475C>T (p.Arg159Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.821_822del (p.Leu274fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.1124G>A (p.Arg375Gln) 错义突变 罕见 可能影响DNA结合
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,导致SIM1蛋白功能丧失或降低,影响下丘脑发育和功能,导致肥胖等表型。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SIM1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型SIM1的功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000978 • GO:0000981
• GO:0005515 • GO:0005634
• GO:0006355 • GO:0006357
• GO:0006366 • GO:0008134
• GO:0045944

相关通路

hsa04919: Thyroid hormone signaling pathway
hsa05034: Alcoholism
hsa05200: Pathways in cancer

蛋白质功能简介

SIM1蛋白包含bHLH结构域和PAS结构域,能够与ARNT(HIF1β)形成异二聚体,结合DNA上的E-box序列,调控靶基因转录。在下丘脑室旁核和视上核中,SIM1调节促甲状腺激素释放激素(TRH)和催产素等神经肽的表达,参与能量代谢和水平衡的调节。

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