SIPA1L3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SIPA1L3编码Rap GTP酶激活蛋白,参与细胞信号调控,与青光眼和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SIPA1L3 |
|---|---|
| 基因全名 | signal-induced proliferation-associated 1 like 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19q13.32 |
| NCBI Gene ID | 23094 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23094 |
| Ensembl ID | ENSG00000104872 |
| UniProt ID | O60292 |
| OMIM ID | 616955 |
| HGNC ID | 23804 |
| 基因别名 | SPAR3, SPAL3 |
基因功能与研究简介
SIPA1L3(signal-induced proliferation-associated 1 like 3)基因编码Rap GTP酶激活蛋白(RapGAP),属于SIPA1L家族。该蛋白通过负调控Rap1和Rap2的活性,参与细胞增殖、分化、迁移和凋亡等信号通路。SIPA1L3在多种组织中表达,尤其在脑、眼和肾脏中高表达。研究表明,SIPA1L3突变与原发性先天性青光眼(PCG)相关,并可能参与癌症的发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 原发性先天性青光眼 | SIPA1L3突变导致RapGAP活性改变,影响小梁网发育和房水流出,导致眼压升高。 | 已明确致病 |
| 癌症 | SIPA1L3在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控Rap信号影响肿瘤细胞增殖和转移。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 眼 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2065C>T (p.Arg689Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | Loss of Function |
| c.2386G>A (p.Gly796Arg) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):无义突变导致截短蛋白,丧失RapGAP活性,影响信号通路。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005096 (GTPase activator activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• Rap1 signaling pathway (Reactome: R-HSA-392517)
• Rap2 signaling pathway (Reactome: R-HSA-392518)
蛋白质功能简介
SIPA1L3蛋白包含一个N端的RapGAP结构域和一个C端的PDZ结构域,通过催化Rap1和Rap2从GTP结合状态转变为GDP结合状态,负调控Rap信号通路。该蛋白在细胞骨架重塑、细胞黏附和迁移中发挥重要作用。