SKA1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SKA1是纺锤体与动粒相关蛋白复合物的核心亚基,对细胞有丝分裂的染色体正确分离至关重要,其异常表达与多种癌症的发生发展密切相关。

基因信息卡

基因符号 SKA1
基因全名 Spindle and kinetochore associated complex subunit 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 18q21.1
NCBI Gene ID 220134 ncbi.nlm.nih.gov/gene/220134
Ensembl ID ENSG00000154856
UniProt ID Q96B36
OMIM ID 616569
HGNC ID 20262
基因别名 C18orf3, FLJ12806, MGC10254

基因功能与研究简介

SKA1(纺锤体与动粒相关复合物亚基1)是SKA复合物的核心成分,该复合物由SKA1、SKA2和SKA3组成,定位于动粒,在有丝分裂期间稳定微管与动粒的连接,确保染色体正确分离。SKA1通过其N端区域结合微管,并通过C端区域与SKA2和SKA3相互作用。SKA1的缺失或功能异常导致染色体分离错误、非整倍体形成,进而可能促进肿瘤发生。研究表明,SKA1在多种癌症中高表达,与不良预后相关,并参与细胞周期调控、增殖和迁移。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 SKA1在肝细胞癌中高表达,通过促进细胞周期进程和抑制凋亡促进肿瘤生长,与不良预后相关。 较强研究证据
乳腺癌 SKA1在乳腺癌中表达上调,与肿瘤分级和转移相关,可能通过影响有丝分裂稳定性促进肿瘤进展。 较强研究证据
肺癌 SKA1在非小细胞肺癌中高表达,与患者生存期缩短相关,可能作为预后标志物。 较强研究证据
结直肠癌 SKA1在结直肠癌中表达升高,与肿瘤侵袭和转移相关,可能通过调控Wnt/β-catenin通路。 潜在关联
胃癌 SKA1在胃癌组织中表达上调,与淋巴结转移和分期相关,可能作为治疗靶点。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系,常用于有丝分裂研究
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系,SKA1高表达
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系,SKA1表达较高
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.364C>T (p.Arg122Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响未知
c.497A>G (p.Glu166Gly) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性,功能影响未知
c.631C>T (p.Arg211Cys) 错义突变 罕见 可能影响微管结合,功能影响未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

SKA1功能缺失突变可能导致动粒-微管连接不稳定,引起染色体分离错误和非整倍体,但目前在人类疾病中尚无明确的致病性功能缺失突变报道。

Gain of Function(功能获得,GOF)

SKA1过表达或功能获得性突变可能增强动粒-微管连接稳定性,促进细胞增殖,与肿瘤发生相关,但具体功能获得性突变尚未明确。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

SKA1显性负性突变可能干扰SKA复合物组装,破坏微管结合,导致有丝分裂缺陷,但尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005819 (spindle) • GO:0000776 (kinetochore)
• GO:0008017 (microtubule binding) • GO:0007059 (chromosome segregation)
• GO:0005813 (centrosome)

相关通路

Cell Cycle (KEGG: hsa04110)
Oocyte meiosis (KEGG: hsa04114)
Progesterone-mediated oocyte maturation (KEGG: hsa04914)

蛋白质功能简介

SKA1蛋白由382个氨基酸组成,分子量约42 kDa。其N端包含一个螺旋结构域,负责与微管结合;C端区域介导与SKA2和SKA3的相互作用。SKA1在有丝分裂期间定位于动粒,通过稳定微管连接确保染色体正确分离。此外,SKA1还参与纺锤体检查点信号传导,确保细胞周期正常进行。

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