SKIC2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SKIC2是RNA外泌体辅助因子,参与RNA加工和降解,其突变与智力障碍和生长发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 SKIC2
基因全名 SKIC2 (SKI2 subunit of superkiller complex)
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 6p21.33
NCBI Gene ID 64946 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64946
Ensembl ID ENSG00000112182
UniProt ID Q9Y2S7
OMIM ID 614956
HGNC ID 28312
基因别名 SKIV2L2, MTR4, KIAA0052

基因功能与研究简介

SKIC2基因编码RNA外泌体辅助因子,是超级杀手复合物(SKI complex)的亚基之一。该蛋白具有RNA解旋酶活性,参与RNA加工、降解和质量控制。SKIC2在细胞核和细胞质中均有分布,与RNA外泌体协同作用,降解异常RNA。SKIC2突变可导致智力障碍和生长发育异常,提示其在神经发育中的重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
智力障碍 SKIC2突变导致RNA加工异常,影响神经发育,已明确致病 OMIM, ClinVar
生长发育异常 SKIC2突变影响细胞增殖和分化,导致生长迟缓,已明确致病 OMIM, ClinVar
癌症 SKIC2在多种癌症中表达异常,但具体机制尚不明确,潜在关联 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.567_568del (p.Glu190fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致SKIC2蛋白活性降低或缺失,影响RNA加工,与疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• RNA helicase activity (GO:0003724) • RNA binding (GO:0003723)
• nuclear exosome (RNase complex) (GO:0000176) • cytoplasmic exosome (RNase complex) (GO:0000177)
• RNA catabolic process (GO:0006401)

相关通路

RNA degradation (hsa03018)
mRNA surveillance pathway (hsa03015)

蛋白质功能简介

SKIC2蛋白是RNA外泌体辅助因子,属于SKI复合物,具有RNA解旋酶活性。它参与RNA加工、降解和质量控制,在细胞核和细胞质中均有分布。SKIC2通过解旋RNA底物,促进外泌体对RNA的降解。该蛋白在神经发育中发挥重要作用,其突变可导致智力障碍和生长发育异常。

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