SLC25A21基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
SLC25A21编码线粒体2-氧代二羧酸载体,参与柠檬酸循环和氨基酸代谢,与2-氧代己二酸尿症等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SLC25A21 |
|---|---|
| 基因全名 | solute carrier family 25 member 21 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q13.3 |
| NCBI Gene ID | 89874 ncbi.nlm.nih.gov/gene/89874 |
| Ensembl ID | ENSG00000183032 |
| UniProt ID | Q9BQT8 |
| OMIM ID | 613621 |
| HGNC ID | 29212 |
| 基因别名 | ODC, ODC1, SLC25A21 |
基因功能与研究简介
SLC25A21(溶质载体家族25成员21)编码线粒体2-氧代二羧酸载体,该蛋白位于线粒体内膜,负责将2-氧代己二酸和2-氧代戊二酸等二羧酸转运至线粒体基质,参与赖氨酸、色氨酸和羟脯氨酸的分解代谢,以及柠檬酸循环的中间产物转运。该基因的突变可能导致2-氧代己二酸尿症,一种常染色体隐性遗传的代谢性疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 2-氧代己二酸尿症 | SLC25A21基因突变导致线粒体2-氧代二羧酸载体功能缺陷,影响2-氧代己二酸等代谢物的转运,导致其在尿液中积累。 | 已明确致病 |
| 精神发育迟滞 | 部分患者伴有智力发育迟缓,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
| 肌张力低下 | 部分患者出现肌张力低下,可能与代谢紊乱有关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.844C>T (p.Arg282Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | Loss of Function |
| c.1123A>G (p.Thr375Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):无义突变导致提前终止密码子,产生截短蛋白,丧失转运功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明SLC25A21存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明SLC25A21存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0015297 (antiporter activity) | • GO:0016021 (integral component of membrane) |
| • GO:0005743 (mitochondrial inner membrane) | • GO:0006839 (mitochondrial transport) |
| • GO:0006572 (tyrosine catabolic process) |
相关通路
• Lysine degradation (KEGG: hsa00310)
• Tryptophan metabolism (KEGG: hsa00380)
• Citrate cycle (TCA cycle) (KEGG: hsa00020)
蛋白质功能简介
SLC25A21蛋白是线粒体载体家族(SLC25)成员,包含6个跨膜结构域,形成二聚体发挥转运功能。它主要转运2-氧代己二酸和2-氧代戊二酸,参与赖氨酸、色氨酸和羟脯氨酸的分解代谢。该蛋白的缺陷会导致2-氧代己二酸尿症,表现为尿中2-氧代己二酸水平升高,可能伴有神经系统症状。