SLC26A4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SLC26A4基因编码pendrin蛋白,是碘/氯离子转运的关键分子,其突变与Pendred综合征及非综合征性耳聋密切相关。

基因信息卡

基因符号 SLC26A4
基因全名 solute carrier family 26 member 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q22.3
NCBI Gene ID 5172 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5172
Ensembl ID ENSG00000091137
UniProt ID O43511
OMIM ID 605646
HGNC ID 11018
基因别名 PDS; DFNB4; EVA; Pendrin

基因功能与研究简介

SLC26A4基因编码pendrin蛋白,属于溶质载体家族26成员4,是一种跨膜阴离子交换蛋白,主要介导碘化物、氯离子和碳酸氢盐的跨膜转运。该基因在甲状腺、内耳和肾脏中高表达,对甲状腺激素合成、内耳内淋巴液稳态和肾脏酸碱平衡至关重要。SLC26A4基因突变可导致Pendred综合征(以甲状腺肿和感音神经性耳聋为特征)以及非综合征性耳聋(DFNB4型)。此外,SLC26A4突变也与大前庭导水管综合征(EVA)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Pendred综合征 SLC26A4基因突变导致pendrin蛋白功能丧失,影响甲状腺碘转运和内耳氯离子/碳酸氢盐交换,引起甲状腺肿和感音神经性耳聋。 已明确致病
非综合征性耳聋(DFNB4型) SLC26A4基因突变导致内耳内淋巴液离子平衡失调,损害听觉毛细胞功能,引起常染色体隐性遗传性耳聋。 已明确致病
大前庭导水管综合征(EVA) SLC26A4基因突变导致内耳发育异常,前庭导水管扩大,常伴有感音神经性耳聋。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
甲状腺 暂无可靠数据 高表达
内耳 暂无可靠数据 高表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
甲状腺滤泡上皮细胞 暂无可靠数据 pendrin表达于顶膜
内耳毛细胞 暂无可靠数据 pendrin表达于内淋巴管
肾集合管闰细胞 暂无可靠数据 pendrin表达于顶膜
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.707A>G (p.Glu236Gly) 错义突变 常见于亚洲人群 功能丧失
c.919-2A>G 剪接突变 常见于亚洲人群 功能丧失
c.2168A>G (p.His723Arg) 错义突变 较少见 功能丧失
c.1334T>C (p.Leu445Pro) 错义突变 较少见 功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数SLC26A4突变导致pendrin蛋白功能丧失,包括错义突变、剪接突变和移码突变,影响蛋白的合成、折叠或转运活性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SLC26A4存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SLC26A4突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005254 chloride channel activity • GO:0005452 inorganic anion exchanger activity
• GO:0008510 sodium:iodide symporter activity • GO:0015705 iodide transport
• GO:0015698 inorganic anion transport • GO:0005886 plasma membrane
• GO:0016324 apical plasma membrane

相关通路

Iodine metabolism
Thyroid hormone synthesis
Chloride transport
Bicarbonate transport

蛋白质功能简介

Pendrin蛋白由SLC26A4基因编码,含有约780个氨基酸,分子量约86 kDa。该蛋白属于SLC26家族,具有多个跨膜结构域,N端和C端位于胞质侧。Pendrin主要表达于甲状腺滤泡上皮细胞的顶膜、内耳内淋巴管和肾脏集合管闰细胞的顶膜,介导氯离子和碘离子的交换,以及氯离子和碳酸氢盐的交换。在甲状腺中,pendrin参与碘离子向滤泡腔的转运,对甲状腺激素合成至关重要;在内耳中,pendrin维持内淋巴液的离子平衡,对听觉功能至关重要;在肾脏中,pendrin参与酸碱平衡调节。

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