SLC26A4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SLC26A4基因编码pendrin蛋白,是碘/氯离子转运的关键分子,其突变与Pendred综合征及非综合征性耳聋密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SLC26A4 |
|---|---|
| 基因全名 | solute carrier family 26 member 4 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7q22.3 |
| NCBI Gene ID | 5172 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5172 |
| Ensembl ID | ENSG00000091137 |
| UniProt ID | O43511 |
| OMIM ID | 605646 |
| HGNC ID | 11018 |
| 基因别名 | PDS; DFNB4; EVA; Pendrin |
基因功能与研究简介
SLC26A4基因编码pendrin蛋白,属于溶质载体家族26成员4,是一种跨膜阴离子交换蛋白,主要介导碘化物、氯离子和碳酸氢盐的跨膜转运。该基因在甲状腺、内耳和肾脏中高表达,对甲状腺激素合成、内耳内淋巴液稳态和肾脏酸碱平衡至关重要。SLC26A4基因突变可导致Pendred综合征(以甲状腺肿和感音神经性耳聋为特征)以及非综合征性耳聋(DFNB4型)。此外,SLC26A4突变也与大前庭导水管综合征(EVA)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Pendred综合征 | SLC26A4基因突变导致pendrin蛋白功能丧失,影响甲状腺碘转运和内耳氯离子/碳酸氢盐交换,引起甲状腺肿和感音神经性耳聋。 | 已明确致病 |
| 非综合征性耳聋(DFNB4型) | SLC26A4基因突变导致内耳内淋巴液离子平衡失调,损害听觉毛细胞功能,引起常染色体隐性遗传性耳聋。 | 已明确致病 |
| 大前庭导水管综合征(EVA) | SLC26A4基因突变导致内耳发育异常,前庭导水管扩大,常伴有感音神经性耳聋。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 内耳 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 甲状腺滤泡上皮细胞 | 暂无可靠数据 | pendrin表达于顶膜 |
| 内耳毛细胞 | 暂无可靠数据 | pendrin表达于内淋巴管 |
| 肾集合管闰细胞 | 暂无可靠数据 | pendrin表达于顶膜 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.707A>G (p.Glu236Gly) | 错义突变 | 常见于亚洲人群 | 功能丧失 |
| c.919-2A>G | 剪接突变 | 常见于亚洲人群 | 功能丧失 |
| c.2168A>G (p.His723Arg) | 错义突变 | 较少见 | 功能丧失 |
| c.1334T>C (p.Leu445Pro) | 错义突变 | 较少见 | 功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数SLC26A4突变导致pendrin蛋白功能丧失,包括错义突变、剪接突变和移码突变,影响蛋白的合成、折叠或转运活性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SLC26A4存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SLC26A4突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005254 chloride channel activity | • GO:0005452 inorganic anion exchanger activity |
| • GO:0008510 sodium:iodide symporter activity | • GO:0015705 iodide transport |
| • GO:0015698 inorganic anion transport | • GO:0005886 plasma membrane |
| • GO:0016324 apical plasma membrane |
相关通路
• Iodine metabolism
• Thyroid hormone synthesis
• Chloride transport
• Bicarbonate transport
蛋白质功能简介
Pendrin蛋白由SLC26A4基因编码,含有约780个氨基酸,分子量约86 kDa。该蛋白属于SLC26家族,具有多个跨膜结构域,N端和C端位于胞质侧。Pendrin主要表达于甲状腺滤泡上皮细胞的顶膜、内耳内淋巴管和肾脏集合管闰细胞的顶膜,介导氯离子和碘离子的交换,以及氯离子和碳酸氢盐的交换。在甲状腺中,pendrin参与碘离子向滤泡腔的转运,对甲状腺激素合成至关重要;在内耳中,pendrin维持内淋巴液的离子平衡,对听觉功能至关重要;在肾脏中,pendrin参与酸碱平衡调节。
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