SLC35C1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
SLC35C1编码GDP-岩藻糖转运蛋白,其突变导致白细胞黏附缺陷II型(LAD II),在炎症和免疫中发挥关键作用。
基因信息卡
| 基因符号 | SLC35C1 |
|---|---|
| 基因全名 | solute carrier family 35 member C1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11p11.2 |
| NCBI Gene ID | 55343 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55343 |
| Ensembl ID | ENSG00000149269 |
| UniProt ID | Q96A29 |
| OMIM ID | 605881 |
| HGNC ID | 20197 |
| 基因别名 | FUCT1, FLJ11328 |
基因功能与研究简介
SLC35C1基因编码GDP-岩藻糖转运蛋白,该蛋白位于高尔基体膜上,负责将GDP-岩藻糖从细胞质转运至高尔基体腔,参与岩藻糖基化过程。岩藻糖基化是多种糖蛋白和糖脂合成的重要步骤,影响细胞黏附、免疫应答等生物学功能。SLC35C1基因突变导致白细胞黏附缺陷II型(LAD II),表现为反复感染、智力发育迟缓等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 白细胞黏附缺陷II型(LAD II) | SLC35C1基因突变导致GDP-岩藻糖转运蛋白功能丧失,使岩藻糖基化缺陷,影响选择素配体合成,导致白细胞黏附异常,引起反复感染、智力发育迟缓等。 | 已明确致病(OMIM) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.921G>T (p.Trp307Cys) | 错义突变 | 罕见 | Loss of Function(功能丧失):影响蛋白转运活性 |
| c.1044C>A (p.Tyr348*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function(功能丧失):导致蛋白截短 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失):SLC35C1突变导致GDP-岩藻糖转运蛋白活性降低或缺失,影响岩藻糖基化。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005459(GDP-岩藻糖跨膜转运蛋白活性) | • GO:0016021(膜组分) |
| • GO:0005794(高尔基体) | • GO:0015780(GDP-岩藻糖转运) |
相关通路
• 岩藻糖基化(Fucosylation)
• 白细胞黏附(Leukocyte adhesion)
蛋白质功能简介
SLC35C1蛋白是GDP-岩藻糖转运蛋白,属于SLC35家族。该蛋白位于高尔基体膜,负责将GDP-岩藻糖从细胞质转运至高尔基体腔,为岩藻糖基转移酶提供底物。岩藻糖基化修饰对选择素配体等功能至关重要。SLC35C1突变导致LAD II,影响免疫细胞黏附。