SLC35D1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

SLC35D1编码UDP-葡萄糖醛酸/UDP-N-乙酰半乳糖胺转运蛋白,参与糖胺聚糖合成,其突变可导致致死性骨发育不良。

基因信息卡

基因符号 SLC35D1
基因全名 solute carrier family 35 member D1
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p31.3
NCBI Gene ID 23169 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23169
Ensembl ID ENSG00000143110
UniProt ID Q9NTN3
OMIM ID 610804
HGNC ID 20618
基因别名 FLJ10631, UGTrel1

基因功能与研究简介

SLC35D1基因编码溶质载体家族35成员D1,是一种内质网定位的UDP-葡萄糖醛酸(UDP-GlcA)和UDP-N-乙酰半乳糖胺(UDP-GalNAc)转运蛋白。该蛋白在蛋白聚糖的糖胺聚糖链合成中发挥关键作用,将UDP-GlcA和UDP-GalNAc从细胞质转运至内质网腔,供糖基转移酶使用。SLC35D1的功能缺失突变可导致致死性骨发育不良( Schneckenbecken dysplasia),一种罕见的常染色体隐性遗传病。此外,SLC35D1在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Schneckenbecken dysplasia SLC35D1基因纯合或复合杂合突变导致功能丧失,影响UDP-葡萄糖醛酸和UDP-N-乙酰半乳糖胺的转运,进而干扰软骨内骨化过程中蛋白聚糖的合成,导致骨骼发育异常。 已明确致病(OMIM 269250)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
软骨 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.344G>A (p.Arg115His) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,导致转运活性降低
c.679C>T (p.Arg227*) 无义突变 暂无可靠数据 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

SLC35D1的错义或无义突变可导致蛋白功能丧失,影响UDP-糖转运,是Schneckenbecken dysplasia的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SLC35D1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SLC35D1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005459 (UDP-galactose transmembrane transporter activity) • GO:0015165 (UDP-N-acetylgalactosamine transmembrane transporter activity)
• GO:0015780 (UDP-N-acetylgalactosamine transport) • GO:0015781 (UDP-glucose transport)
• GO:0016021 (integral component of membrane) • GO:0005783 (endoplasmic reticulum)

相关通路

Glycosaminoglycan biosynthesis - chondroitin sulfate / dermatan sulfate (Reactome: R-HSA-1971475)
Keratan sulfate biosynthesis (Reactome: R-HSA-2022857)

蛋白质功能简介

SLC35D1蛋白由339个氨基酸组成,分子量约37 kDa,属于溶质载体家族35(SLC35)成员。该蛋白定位于内质网膜,包含多个跨膜结构域,负责将UDP-葡萄糖醛酸和UDP-N-乙酰半乳糖胺从细胞质转运至内质网腔。这些糖核苷酸是糖胺聚糖链合成的重要底物,因此SLC35D1在蛋白聚糖的合成中起关键作用。SLC35D1的功能缺失会导致软骨发育异常,表明其在骨骼发育中的重要性。

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