SLC35D3基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

SLC35D3编码UDP-葡萄糖醛酸/UDP-N-乙酰半乳糖胺转运蛋白,参与蛋白聚糖合成,与血小板致密颗粒缺陷及代谢综合征相关。

基因信息卡

基因符号 SLC35D3
基因全名 solute carrier family 35 member D3
基因类型 protein-coding
染色体位置 6q23.2
NCBI Gene ID 112495 ncbi.nlm.nih.gov/gene/112495
Ensembl ID ENSG00000112658
UniProt ID Q5T8M4
OMIM ID 610292
HGNC ID 21617
基因别名 FRCL1, MGC26597

基因功能与研究简介

SLC35D3(solute carrier family 35 member D3)编码UDP-葡萄糖醛酸/UDP-N-乙酰半乳糖胺转运蛋白,属于SLC35D家族。该蛋白定位于内质网和高尔基体,参与蛋白聚糖的合成,将UDP-葡萄糖醛酸和UDP-N-乙酰半乳糖胺转运至内质网/高尔基体腔。SLC35D3在血小板中高表达,其功能缺失与血小板致密颗粒缺陷相关,导致出血倾向。此外,SLC35D3基因变异与代谢综合征(如肥胖、胰岛素抵抗)存在关联。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
血小板致密颗粒缺陷 SLC35D3功能缺失导致血小板致密颗粒形成异常,影响血小板聚集和止血。 已明确致病
代谢综合征 SLC35D3基因变异与肥胖、胰岛素抵抗等代谢异常相关,但机制尚不完全清楚。 具有较强研究证据
癌症 暂无明确证据表明SLC35D3直接参与癌症发生,但SLC35D3在多种肿瘤中表达异常,可能影响肿瘤微环境。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
血小板 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
脾脏 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 内源性表达低,常用于异源表达
HeLa 暂无可靠数据 低表达
K562 暂无可靠数据 中等表达
MEG-01 暂无可靠数据 高表达(巨核细胞系)
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1046C>T (p.Pro349Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与代谢综合征相关
c.1243C>T (p.Arg415Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失,与血小板致密颗粒缺陷相关
c.1285G>A (p.Gly429Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性,功能影响待验证
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变(Loss of Function):如无义突变导致截短蛋白,或错义突变影响蛋白稳定性或转运活性,导致SLC35D3功能缺失,影响血小板致密颗粒形成。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变(Gain of Function):目前暂无明确证据表明SLC35D3存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变(Dominant Negative):目前暂无明确证据表明SLC35D3存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005459 (UDP-galactose transmembrane transporter activity) • GO:0015165 (UDP-N-acetylgalactosamine transmembrane transporter activity)
• GO:0015780 (UDP-N-acetylgalactosamine transport) • GO:0015781 (UDP-galactose transport)
• GO:0005794 (Golgi apparatus) • GO:0005783 (endoplasmic reticulum)

相关通路

Glycosaminoglycan biosynthesis - chondroitin sulfate / dermatan sulfate (Reactome: R-HSA-1971475)
Glycosaminoglycan metabolism (Reactome: R-HSA-1638091)

蛋白质功能简介

SLC35D3蛋白属于SLC35D家族,为多次跨膜蛋白,定位于内质网和高尔基体。其功能是将UDP-葡萄糖醛酸和UDP-N-乙酰半乳糖胺从细胞质转运至内质网/高尔基体腔,为蛋白聚糖的合成提供底物。在血小板中,SLC35D3对于致密颗粒的形成至关重要,其功能缺失导致致密颗粒缺陷。此外,SLC35D3可能参与代谢调控,与肥胖和胰岛素抵抗相关。

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