SLC39A13基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SLC39A13编码锌转运蛋白ZIP13,参与细胞内锌稳态,其突变与Ehlers-Danlos综合征和骨发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SLC39A13 |
|---|---|
| 基因全名 | solute carrier family 39 member 13 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q12.2 |
| NCBI Gene ID | 91252 ncbi.nlm.nih.gov/gene/91252 |
| Ensembl ID | ENSG00000165915 |
| UniProt ID | Q96NE9 |
| OMIM ID | 608735 |
| HGNC ID | 20859 |
| 基因别名 | ZIP13, LZT-Hs9, bA535K18.1 |
基因功能与研究简介
SLC39A13基因编码锌转运蛋白ZIP13,属于SLC39家族,负责将锌离子从细胞外或细胞器转运至细胞质,维持细胞内锌稳态。该蛋白定位于高尔基体和内质网,参与骨和结缔组织的发育。SLC39A13基因突变可导致Ehlers-Danlos综合征(EDS)和骨发育异常,如脊柱干骺端发育不良。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Ehlers-Danlos综合征(EDS) | SLC39A13基因突变导致ZIP13功能缺失,影响锌转运,导致胶原蛋白合成和分泌异常,进而引起结缔组织缺陷。 | 已明确致病 |
| 脊柱干骺端发育不良 | SLC39A13突变导致骨发育异常,表现为脊柱和干骺端异常,与锌稳态失调有关。 | 已明确致病 |
| 癌症相关 | 暂无明确证据表明SLC39A13直接参与癌症发生,但锌稳态失调可能影响肿瘤微环境。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.221G>A (p.Gly74Asp) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
| c.463C>T (p.Arg155Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.568G>A (p.Gly190Arg) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致ZIP13蛋白功能丧失,影响锌转运,是EDS和骨发育异常的主要机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):暂无明确证据表明SLC39A13突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):暂无明确证据表明SLC39A13突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005385 (zinc ion transmembrane transporter activity) | • GO:0006811 (ion transport) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0005794 (Golgi apparatus) |
| • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
相关通路
• Zinc homeostasis (Reactome: R-HSA-435354)
• Metal ion transport (Reactome: R-HSA-425393)
蛋白质功能简介
ZIP13蛋白由SLC39A13基因编码,属于锌转运蛋白家族,主要定位于高尔基体和内质网,负责将锌离子转运至细胞质。该蛋白在骨和结缔组织发育中起关键作用,其功能缺失可导致胶原蛋白合成异常,进而引发Ehlers-Danlos综合征和骨发育异常。