SLC49A4基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

SLC49A4(FLVCR2)编码一种参与血红素转运的膜蛋白,其突变与增殖性血管病变相关,并在多种癌症中异常表达。

基因信息卡

基因符号 SLC49A4
基因全名 solute carrier family 49 member 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q24.3
NCBI Gene ID 55652 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55652
Ensembl ID ENSG00000100804
UniProt ID Q9UPI3
OMIM ID 610043
HGNC ID 19871
基因别名 FLVCR2, C14orf58, FLJ11467, MFSD7C

基因功能与研究简介

SLC49A4(solute carrier family 49 member 4),又称FLVCR2,属于主要协助转运蛋白超家族(MFS),编码一种跨膜蛋白,参与血红素(heme)的转运。该基因位于染色体14q24.3,包含多个外显子。SLC49A4在多种组织中表达,尤其在胎盘、肝脏和肾脏中较高。其功能涉及血红素稳态、细胞增殖和血管发育。SLC49A4的突变与增殖性血管病变(proliferative vasculopathy)相关,如致死性先天性挛缩综合征(LCCS)和Fowler综合征。此外,SLC49A4在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生和发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
致死性先天性挛缩综合征(Lethal Congenital Contracture Syndrome, LCCS) SLC49A4基因突变导致编码蛋白功能丧失,影响血红素转运,进而导致血管发育异常和神经肌肉缺陷。 OMIM 610043;ClinVar记录致病性变异
Fowler综合征(Fowler syndrome) SLC49A4基因突变导致蛋白功能丧失,与增殖性血管病变相关,表现为脑积水、挛缩和血管增生。 OMIM 225790;ClinVar记录致病性变异
癌症(多种类型) SLC49A4在多种癌症中表达异常,可能通过调节血红素稳态影响肿瘤细胞增殖和凋亡,但具体机制尚不明确。 COSMIC数据库显示多种肿瘤中体细胞突变;文献报道(PMID: 23455423等)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
胎盘 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1124G>A (p.Arg375His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与LCCS相关(ClinVar)
c.1366C>T (p.Arg456*) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失,与Fowler综合征相关(ClinVar)
c.1543delC (p.Leu515Trpfs*2) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失,与LCCS相关(ClinVar)
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变、移码突变,导致蛋白截短或降解,影响血红素转运功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SLC49A4存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SLC49A4存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005215 (transporter activity) • GO:0015232 (heme transmembrane transporter activity)
• GO:0016021 (integral component of membrane) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0006810 (transport) • GO:0006879 (cellular iron ion homeostasis)

相关通路

Heme transport (Reactome: R-HSA-917937)
Iron uptake and transport (Reactome: R-HSA-917937)

蛋白质功能简介

SLC49A4(FLVCR2)是一种跨膜蛋白,属于主要协助转运蛋白超家族(MFS),预测具有12个跨膜结构域。该蛋白参与血红素(heme)的跨膜转运,对维持细胞内血红素稳态至关重要。在胎盘、肝脏和肾脏中高表达,提示其在血红素代谢活跃组织中的重要作用。SLC49A4的功能缺失突变导致增殖性血管病变,表明其在血管发育中的关键角色。此外,SLC49A4在多种癌症中表达异常,可能通过调节血红素水平影响肿瘤细胞生长。

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