SLC6A18基因|基因功能、疾病关联、突变与药物靶点研究
SLC6A18编码一种钠离子依赖的氨基酸转运蛋白,主要在肾脏表达,参与中性氨基酸的重吸收,其突变与亚氨基甘氨酸尿症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SLC6A18 |
|---|---|
| 基因全名 | solute carrier family 6 member 18 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5p15.33 |
| NCBI Gene ID | 348932 ncbi.nlm.nih.gov/gene/348932 |
| Ensembl ID | ENSG00000164362 |
| UniProt ID | Q96N87 |
| OMIM ID | 610300 |
| HGNC ID | 27970 |
| 基因别名 | XTRP2, B(0)AT3 |
基因功能与研究简介
SLC6A18(溶质载体家族6成员18)编码一种钠离子依赖的中性氨基酸转运蛋白,属于SLC6家族。该蛋白主要在肾脏近端小管表达,介导中性氨基酸(如甘氨酸、脯氨酸、丙氨酸等)的重吸收。SLC6A18与SLC6A19(B0AT1)形成异源二聚体,共同参与氨基酸的转运。SLC6A18基因突变可导致亚氨基甘氨酸尿症(iminoglycinuria),这是一种良性遗传病,表现为尿中甘氨酸、脯氨酸和羟脯氨酸排泄增加。此外,SLC6A18可能参与血压调节,但证据尚不充分。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 亚氨基甘氨酸尿症 | SLC6A18基因突变导致其编码的转运蛋白功能丧失或表达异常,影响肾脏对甘氨酸、脯氨酸和羟脯氨酸的重吸收,导致这些氨基酸在尿中过量排泄。 | 已明确致病(OMIM 610300) |
| 高血压 | SLC6A18可能通过影响氨基酸代谢或肾脏钠离子转运参与血压调节,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联(研究证据有限) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于RNA和蛋白研究) |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HK-2(人肾皮质近曲小管上皮细胞) | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| Caco-2(人结直肠腺癌细胞) | 暂无可靠数据 | 低表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1285C>T (p.Arg429Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function(功能丧失) |
| c.1195G>A (p.Gly399Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白折叠或转运功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失):突变导致蛋白功能缺失或显著降低,如无义突变导致的截短蛋白。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明SLC6A18存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明SLC6A18存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006814 (sodium ion transport) | • GO:0006865 (amino acid transport) |
| • GO:0015293 (symporter activity) | • GO:0016021 (integral component of membrane) |
相关通路
• hsa04976 (Bile secretion)
• hsa04974 (Protein digestion and absorption)
蛋白质功能简介
SLC6A18蛋白(UniProt Q96N87)是一种钠离子依赖的中性氨基酸转运蛋白,属于SLC6家族。该蛋白由约638个氨基酸组成,包含12个跨膜结构域,N端和C端均位于胞内。SLC6A18主要与SLC6A19形成异源二聚体,在肾脏近端小管刷状缘膜上表达,负责中性氨基酸的重吸收。其底物包括甘氨酸、脯氨酸、丙氨酸等。SLC6A18的突变可导致亚氨基甘氨酸尿症,但该病通常为良性,无需治疗。此外,SLC6A18可能参与血压调节,但机制尚不明确。