SLIRP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SLIRP(SRA Stem-Loop Interacting RNA Binding Protein)是线粒体基因表达调控的关键蛋白,参与线粒体RNA加工与翻译,其功能异常与线粒体疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SLIRP
基因全名 SRA Stem-Loop Interacting RNA Binding Protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q24.3
NCBI Gene ID 79152 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79152
Ensembl ID ENSG00000100823
UniProt ID Q8N3F8
OMIM ID 614502
HGNC ID 24516
基因别名 C14orf31, DC50, MGC111024

基因功能与研究简介

SLIRP基因编码一种RNA结合蛋白,主要定位于线粒体,参与线粒体RNA的加工、稳定性和翻译调控。SLIRP与LRPPRC形成复合物,共同调控线粒体基因的表达。SLIRP功能异常可能导致线粒体功能障碍,与多种线粒体疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
线粒体复合体IV缺乏症 SLIRP突变导致线粒体呼吸链复合体IV(细胞色素c氧化酶)组装或活性受损,影响氧化磷酸化,导致能量代谢障碍。 ClinVar, OMIM
Leigh综合征 SLIRP突变可能引起线粒体功能障碍,与Leigh综合征的病理机制相关,但证据有限。 OMIM
线粒体疾病(广义) SLIRP功能异常影响线粒体基因表达,可能参与多种线粒体疾病的发病机制。 UniProt, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.143G>A (p.Arg48His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,导致线粒体功能障碍
c.286C>T (p.Arg96Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

SLIRP功能缺失突变(如无义突变、移码突变)导致蛋白功能丧失,影响线粒体RNA加工和翻译,导致线粒体功能障碍。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SLIRP存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SLIRP突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 (RNA binding) • GO:0005739 (mitochondrion)
• GO:0006397 (mRNA processing) • GO:0006412 (translation)

相关通路

Mitochondrial gene expression (Reactome: R-HSA-5368287)
Respiratory electron transport (Reactome: R-HSA-611105)

蛋白质功能简介

SLIRP蛋白由109个氨基酸组成,含有RNA结合结构域,主要定位于线粒体。它与LRPPRC形成复合物,参与线粒体mRNA的稳定性维持和翻译调控。SLIRP对线粒体呼吸链复合物的组装和功能至关重要,其功能异常可导致线粒体疾病。

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