SLIT1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

SLIT1编码分泌性糖蛋白,参与轴突导向和细胞迁移,与神经系统发育及多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SLIT1
基因全名 slit guidance ligand 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q24.1
NCBI Gene ID 6585 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6585
Ensembl ID ENSG00000187193
UniProt ID O75093
OMIM ID 603746
HGNC ID 11016
基因别名 SLIT3, Slit homolog 1, slit homolog 1 (Drosophila)

基因功能与研究简介

SLIT1基因编码Slit家族的分泌性糖蛋白,在神经系统发育中作为轴突导向分子,通过结合Robo受体发挥排斥或导向作用。SLIT1还参与细胞迁移、血管生成和免疫调节等过程。其表达异常与多种神经系统疾病和癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神分裂症 SLIT1基因变异可能影响神经发育和突触可塑性,增加精神分裂症风险。 有研究证据,但尚未明确致病
自闭症谱系障碍 SLIT1在轴突导向中的作用可能影响神经连接,与自闭症相关。 有研究证据,但尚未明确致病
结直肠癌 SLIT1表达下调可能促进肿瘤侵袭和转移。 有研究证据,但尚未明确致病
肾细胞癌 SLIT1甲基化导致表达沉默,与肿瘤进展相关。 有研究证据,但尚未明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
脊髓 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs11122119 SNV 未知 可能影响基因表达,与精神分裂症相关
c.1234C>T 点突变 未知 可能导致氨基酸改变,功能影响未知
启动子甲基化 表观遗传 常见 导致基因沉默,与癌症相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变,导致SLIT1蛋白表达减少或功能丧失,可能影响轴突导向和细胞迁移。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,目前暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,目前暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005102 (signaling receptor binding) • GO:0007155 (cell adhesion)
• GO:0007411 (axon guidance) • GO:0030334 (regulation of cell migration)
• GO:0005615 (extracellular space)

相关通路

Axon guidance (hsa04360)
Signaling by Robo receptor (R-HSA-428542)

蛋白质功能简介

SLIT1蛋白属于Slit家族,为分泌性糖蛋白,含有多个EGF样结构域和LRR结构域。它通过结合Robo受体发挥轴突导向作用,抑制神经元迁移和轴突生长。SLIT1还参与细胞迁移、血管生成和免疫调节,其表达异常与多种疾病相关。

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