SLITRK2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SLITRK2编码一种参与神经突触发育和神经元分化的跨膜蛋白,其突变与精神神经疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SLITRK2
基因全名 SLITRK family member 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xq27.3
NCBI Gene ID 84631 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84631
Ensembl ID ENSG00000185985
UniProt ID Q9H156
OMIM ID 300561
HGNC ID 13429
基因别名 CXorf2, SLITL1

基因功能与研究简介

SLITRK2(SLIT and NTRK-like family member 2)基因编码一种I型跨膜蛋白,属于SLITRK家族。该蛋白包含富含亮氨酸重复序列(LRR)和C端保守区域,主要表达于神经系统中,参与突触形成、神经元分化以及轴突生长调控。SLITRK2在脑发育和功能中发挥重要作用,其异常表达或突变与多种神经精神疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神分裂症 SLITRK2基因变异可能影响突触功能,增加精神分裂症风险。 关联研究
双相情感障碍 SLITRK2表达异常可能参与双相情感障碍的病理过程。 关联研究
自闭症谱系障碍 SLITRK2突变可能影响神经元连接,与自闭症相关。 病例报道
强迫症 SLITRK2基因多态性与强迫症易感性相关。 关联研究

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
脊髓 暂无可靠数据 中等表达
睾丸 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
SK-N-SH 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
U87 暂无可靠数据 胶质母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 可能导致截短蛋白,功能丧失
c.456_459del (p.Glu153fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
c.789A>G (p.Ile263Val) 错义突变 低频 可能影响蛋白结构,功能未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变和移码突变导致蛋白截短,可能引起功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005886 (plasma membrane) • GO:0005887 (integral component of plasma membrane)
• GO:0007399 (nervous system development) • GO:0007411 (axon guidance)
• GO:0030054 (cell junction) • GO:0045202 (synapse)

相关通路

Axon guidance (hsa04360)
Neuroactive ligand-receptor interaction (hsa04080)

蛋白质功能简介

SLITRK2蛋白是一种单次跨膜蛋白,包含信号肽、胞外LRR结构域和胞内短尾。LRR结构域介导蛋白-蛋白相互作用,可能参与细胞黏附。SLITRK2在神经元中高表达,定位于突触,调节突触形成和功能。其胞内域可能通过与其他蛋白相互作用参与信号转导。

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