SLITRK6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SLITRK6编码一种跨膜蛋白,参与神经突触发育与维持,其突变与遗传性耳聋和近视相关。

基因信息卡

基因符号 SLITRK6
基因全名 SLITRK6 (SLIT and NTRK-like family, member 6)
基因类型 protein-coding
染色体位置 13q31.1
NCBI Gene ID 84189 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84189
Ensembl ID ENSG00000102974
UniProt ID Q9H5Y7
OMIM ID 609681
HGNC ID 23503
基因别名 DFNB67, bA364G4.2

基因功能与研究简介

SLITRK6基因编码SLIT和NTRK样家族成员6蛋白,该蛋白是一种跨膜蛋白,主要表达于神经系统,参与突触形成和神经元分化。SLITRK6通过其胞外域与受体相互作用,调节神经突生长和突触功能。该基因突变与常染色体隐性遗传性耳聋(DFNB67)和高度近视相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
常染色体隐性遗传性耳聋67型(DFNB67) SLITRK6基因纯合或复合杂合突变导致蛋白功能丧失,影响内耳毛细胞和螺旋神经节发育,导致听力障碍。 已明确致病
高度近视 SLITRK6突变与高度近视相关,可能通过影响视网膜和巩膜发育导致眼轴增长。 具有较强研究证据
其他神经发育障碍 部分研究提示SLITRK6变异可能与自闭症谱系障碍等神经发育疾病相关,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
内耳 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
U87 暂无可靠数据 胶质母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.937C>T (p.Arg313Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1240C>T (p.Arg414Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1291G>A (p.Gly431Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致蛋白截短或降解,丧失正常功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005886 (plasma membrane) • GO:0007399 (nervous system development)
• GO:0007411 (axon guidance) • GO:0045202 (synapse)

相关通路

暂无明确Pathway ID

蛋白质功能简介

SLITRK6蛋白属于SLITRK家族,包含富含亮氨酸重复序列(LRR)结构域和跨膜结构域。该蛋白主要表达于神经元,参与调控突触形成和神经元分化。SLITRK6通过其胞外域与蛋白酪氨酸磷酸酶受体(如PTPδ)相互作用,调节突触粘附。该蛋白功能丧失与耳聋和近视相关。

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