SMC1B基因|基因功能、疾病关联、突变与减数分裂研究
SMC1B是减数分裂特异性的黏连蛋白亚基,对同源重组和染色体分离至关重要。
基因信息卡
| 基因符号 | SMC1B |
|---|---|
| 基因全名 | structural maintenance of chromosomes 1B |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 22q13.33 |
| NCBI Gene ID | 27127 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27127 |
| Ensembl ID | ENSG00000100320 |
| UniProt ID | Q8NDV3 |
| OMIM ID | 608685 |
| HGNC ID | 11128 |
| 基因别名 | SMC1L2, SMC1beta, FLJ40310 |
基因功能与研究简介
SMC1B基因编码染色体结构维持蛋白家族成员,是减数分裂特异性黏连蛋白复合物的亚基。该蛋白在减数分裂前期参与姐妹染色单体黏连和同源重组,对配子形成至关重要。SMC1B突变可能导致减数分裂异常,与早发性卵巢功能不全(POI)等生殖障碍相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 早发性卵巢功能不全 | SMC1B突变导致减数分裂停滞,卵泡耗竭,引起卵巢功能不全。 | ClinVar, OMIM |
| 非梗阻性无精子症 | SMC1B突变可能影响精子发生,导致无精子症。 | ClinVar, 研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2146C>T (p.Arg716Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2383C>T (p.Arg795Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SMC1B功能缺失突变导致黏连蛋白复合物功能异常,减数分裂停滞。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000794 (condensed nuclear chromosome) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0007062 (sister chromatid cohesion) | • GO:0007131 (reciprocal meiotic recombination) |
| • GO:0000796 (condensin complex) |
相关通路
• Meiotic recombination (Reactome: R-HSA-1500620)
• Cell Cycle
• Mitotic (Reactome: R-HSA-69278)
蛋白质功能简介
SMC1B蛋白是减数分裂特异性黏连蛋白复合物的亚基,与SMC3、RAD21L和STAG3等形成复合物,参与姐妹染色单体黏连和同源重组。该蛋白在减数分裂前期I表达,对染色体轴形成和重组修复至关重要。