SMG5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SMG5是无义介导的mRNA降解(NMD)通路的关键调控因子,参与DNA损伤应答和端粒维持,与多种癌症和遗传性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SMG5
基因全名 SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 1q22
NCBI Gene ID 23381 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23381
Ensembl ID ENSG00000198952
UniProt ID Q9UPR3
OMIM ID 610962
HGNC ID 24643
基因别名 KIAA1092, FLJ12770, MGC142031

基因功能与研究简介

SMG5(SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor)是NMD(无义介导的mRNA降解)通路的核心蛋白之一,与SMG7和SMG5-SMG7异二聚体参与识别含有提前终止密码子的mRNA并介导其降解。SMG5还参与端粒维持和DNA损伤应答,其功能异常与多种癌症和遗传性疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SMG5突变或表达异常可能影响NMD通路,导致异常mRNA积累,促进肿瘤发生。 较强研究证据
遗传性非综合征性智力障碍 SMG5突变可能影响神经发育,但具体机制尚不明确。 潜在关联
端粒相关疾病 SMG5参与端粒维持,其异常可能导致端粒功能障碍。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
MCF7 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但致病性未明确
c.567del (p.Gln189fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

SMG5功能丧失突变可能导致NMD通路缺陷,使异常mRNA积累,可能促进肿瘤发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SMG5存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SMG5存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0000184 nuclear-transcribed mRNA catabolic process • nonsense-mediated decay
• GO:0005634 nucleus • GO:0003723 RNA binding

相关通路

Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway (Reactome: R-HSA-927802)
DNA Damage Response (GO:0006974)

蛋白质功能简介

SMG5蛋白包含一个PIN结构域,具有核酸内切酶活性,参与NMD过程中mRNA的切割。它通过与SMG7形成异二聚体,招募UPF1等因子,促进异常mRNA的降解。此外,SMG5还参与端粒维持和DNA损伤应答,其功能异常与多种疾病相关。

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