SMG5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SMG5是无义介导的mRNA降解(NMD)通路的关键调控因子,参与DNA损伤应答和端粒维持,与多种癌症和遗传性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SMG5 |
|---|---|
| 基因全名 | SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 1q22 |
| NCBI Gene ID | 23381 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23381 |
| Ensembl ID | ENSG00000198952 |
| UniProt ID | Q9UPR3 |
| OMIM ID | 610962 |
| HGNC ID | 24643 |
| 基因别名 | KIAA1092, FLJ12770, MGC142031 |
基因功能与研究简介
SMG5(SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor)是NMD(无义介导的mRNA降解)通路的核心蛋白之一,与SMG7和SMG5-SMG7异二聚体参与识别含有提前终止密码子的mRNA并介导其降解。SMG5还参与端粒维持和DNA损伤应答,其功能异常与多种癌症和遗传性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | SMG5突变或表达异常可能影响NMD通路,导致异常mRNA积累,促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 遗传性非综合征性智力障碍 | SMG5突变可能影响神经发育,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
| 端粒相关疾病 | SMG5参与端粒维持,其异常可能导致端粒功能障碍。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但致病性未明确 |
| c.567del (p.Gln189fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SMG5功能丧失突变可能导致NMD通路缺陷,使异常mRNA积累,可能促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SMG5存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SMG5存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0000184 nuclear-transcribed mRNA catabolic process | • nonsense-mediated decay |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0003723 RNA binding |
相关通路
• Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway (Reactome: R-HSA-927802)
• DNA Damage Response (GO:0006974)
蛋白质功能简介
SMG5蛋白包含一个PIN结构域,具有核酸内切酶活性,参与NMD过程中mRNA的切割。它通过与SMG7形成异二聚体,招募UPF1等因子,促进异常mRNA的降解。此外,SMG5还参与端粒维持和DNA损伤应答,其功能异常与多种疾病相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|