SMG6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SMG6是无义介导的mRNA降解(NMD)通路的关键因子,通过其PIN结构域发挥内切酶活性,调控基因表达和基因组稳定性。

基因信息卡

基因符号 SMG6
基因全名 SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 17p13.3
NCBI Gene ID 23293 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23293
Ensembl ID ENSG00000170322
UniProt ID Q86US8
OMIM ID 610676
HGNC ID 17099
基因别名 C17orf31, EST1A, SMG-6, hSMG6

基因功能与研究简介

SMG6基因编码无义介导的mRNA降解(NMD)通路的关键因子,该蛋白具有PIN(PilT N-terminus)结构域,具有内切酶活性,能够切割含有提前终止密码子的mRNA,从而触发其降解。SMG6还参与端粒维持和DNA损伤反应。SMG6的突变与神经发育障碍和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SMG6突变可能导致NMD功能异常,影响基因表达调控,与神经发育障碍相关。 ClinVar
癌症 SMG6在多种癌症中表达异常,可能通过影响NMD和基因组稳定性参与肿瘤发生。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567delC (p.Leu189Trpfs*5) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能引起功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能使SMG6失去NMD功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004519 (endonuclease activity) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0000184 (nuclear-transcribed mRNA catabolic process • nonsense-mediated decay)
• GO:0000723 (telomere maintenance)

相关通路

Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway (Reactome: R-HSA-927802)
Telomere Maintenance (Reactome: R-HSA-157579)

蛋白质功能简介

SMG6蛋白包含一个PIN结构域,具有内切酶活性,是NMD通路的核心组分。它通过识别含有提前终止密码子的mRNA并切割,促进其降解。此外,SMG6还参与端粒维持和DNA损伤反应。

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