SMN2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SMN2是运动神经元存活的关键基因,其拷贝数和突变影响脊髓性肌萎缩症的严重程度,是SMA治疗的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 SMN2
基因全名 Survival of Motor Neuron 2, Centromeric
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 5q13.2
NCBI Gene ID 6607 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6607
Ensembl ID ENSG00000205571
UniProt ID Q16637
OMIM ID 601627
HGNC ID 11118
基因别名 SMNC; C-BCD541; MGC75079

基因功能与研究简介

SMN2基因编码运动神经元存活蛋白(SMN),该蛋白在RNA剪接、核糖核蛋白组装等过程中发挥关键作用。SMN2与SMN1基因高度同源,但外显子7的C→T转换导致剪接异常,使SMN2产生的全长蛋白较少。SMN2的拷贝数变异与脊髓性肌萎缩症(SMA)的严重程度相关,是SMA修饰基因和药物靶点。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
脊髓性肌萎缩症(SMA) SMN2拷贝数减少或突变导致SMN蛋白不足,引起运动神经元退行性变,导致肌无力。SMN2拷贝数越多,SMA表型越轻。 已明确致病
运动神经元病 SMN2变异可能影响SMN蛋白水平,与运动神经元疾病相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脊髓 暂无可靠数据 SMN蛋白在脊髓运动神经元中高表达
骨骼肌 暂无可靠数据 SMN蛋白在骨骼肌中表达
暂无可靠数据 SMN蛋白在脑组织中表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.840C>T 剪接变异 常见多态性 导致外显子7跳跃,产生截短蛋白,功能部分缺失
拷贝数减少 拷贝数变异 人群中常见 SMN2拷贝数减少导致SMN蛋白不足,增加SMA风险
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

SMN2的剪接变异导致外显子7跳跃,产生截短蛋白,功能部分缺失,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SMN2存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SMN2存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA结合 • GO:0005634 细胞核
• GO:0005681 剪接体复合物 • GO:0006397 mRNA加工
• GO:0008380 RNA剪接

相关通路

mRNA剪接(Reactome: R-HSA-72163)
SMN复合物介导的剪接体组装(Reactome: R-HSA-8953854)

蛋白质功能简介

SMN2编码的SMN蛋白是SMN复合物的核心组分,参与剪接体组装和RNA代谢。SMN蛋白在运动神经元中高表达,其缺失导致选择性剪接异常,影响神经元功能。SMN2蛋白与SMN1蛋白功能相似,但稳定性较低。

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