SMPDL3A基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

SMPDL3A编码鞘磷脂磷酸二酯酶样3A蛋白,参与脂质代谢与细胞信号调控,与肾脏疾病及癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SMPDL3A
基因全名 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3A
基因类型 protein-coding
染色体位置 6q22.31
NCBI Gene ID 10924 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10924
Ensembl ID ENSG00000112210
UniProt ID Q92484
OMIM ID 610974
HGNC ID 11121
基因别名 ASM-like 3A; ASML3A; FLJ20158; MGC126562; MGC126564

基因功能与研究简介

SMPDL3A(鞘磷脂磷酸二酯酶样3A)基因编码一种与酸性鞘磷脂酶相关的蛋白,属于鞘磷脂磷酸二酯酶家族。该蛋白可能参与脂质代谢和细胞信号传导,尤其在肾脏和免疫细胞中表达。研究表明SMPDL3A与肾脏疾病(如局灶节段性肾小球硬化)和某些癌症相关,但其具体功能仍在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
局灶节段性肾小球硬化 SMPDL3A表达下调可能影响肾小球足细胞功能,导致蛋白尿和肾小球硬化。 较强研究证据
肾细胞癌 SMPDL3A在肾细胞癌中表达异常,可能参与肿瘤进展。 潜在关联
肝细胞癌 SMPDL3A表达与肝细胞癌预后相关,可能作为生物标志物。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肾脏 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HK-2 暂无可靠数据 肾近端小管上皮细胞
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1138C>T (p.Arg380Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与FSGS相关
c.1045G>A (p.Asp349Asn) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致SMPDL3A蛋白活性降低或丧失,影响脂质代谢和细胞信号,与肾脏疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明SMPDL3A存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明SMPDL3A存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0008081 (phosphoric diester hydrolase activity) • GO:0006629 (lipid metabolic process)
• GO:0005886 (plasma membrane) • GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

Sphingolipid metabolism (Reactome: R-HSA-428157)
Sphingolipid signaling pathway (KEGG: hsa04071)

蛋白质功能简介

SMPDL3A蛋白属于酸性鞘磷脂酶家族,可能具有磷酸二酯酶活性,参与鞘磷脂代谢。该蛋白定位于细胞膜和细胞质,在肾脏和免疫细胞中表达。研究表明其可能通过调节脂质信号影响细胞增殖和凋亡,与肾脏疾病和癌症相关。

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