SMPDL3B基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

SMPDL3B编码鞘磷脂磷酸二酯酶样3B蛋白,参与脂质代谢与细胞信号调控,与肾脏疾病及癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SMPDL3B
基因全名 sphingomyelin phosphodiesterase acid like 3B
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p35.3
NCBI Gene ID 27293 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27293
Ensembl ID ENSG00000130768
UniProt ID Q92485
OMIM ID 611672
HGNC ID 16011
基因别名 SMPDL3B, ASM-like phosphodiesterase 3b, FLJ22624

基因功能与研究简介

SMPDL3B(鞘磷脂磷酸二酯酶样3B)基因编码一种与酸性鞘磷脂酶相关的蛋白,但缺乏典型的催化活性。该蛋白可能参与脂质代谢和细胞信号传导的调控。研究表明SMPDL3B在肾脏中高表达,并与足细胞损伤和蛋白尿相关。此外,SMPDL3B在多种癌症中表达异常,可能影响肿瘤进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
局灶节段性肾小球硬化 SMPDL3B表达下调与足细胞损伤和蛋白尿相关,可能通过影响脂质信号通路参与疾病发生。 较强研究证据
糖尿病肾病 SMPDL3B表达变化与肾小球滤过功能相关,可能参与糖尿病肾病的病理过程。 潜在关联
肝细胞癌 SMPDL3B在肝细胞癌中表达上调,可能促进肿瘤细胞增殖和迁移。 癌症相关
结直肠癌 SMPDL3B表达异常与结直肠癌的进展和预后相关。 癌症相关

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肾脏 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 内源性表达
HepG2 暂无可靠数据 表达
HK-2 暂无可靠数据 表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs61733184 SNV 0.1% 错义突变,可能影响蛋白功能
rs143739396 SNV 0.05% 错义突变,可能影响蛋白稳定性
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致SMPDL3B蛋白表达减少或活性降低,影响脂质代谢和细胞信号传导,与肾脏疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强SMPDL3B的促癌作用,促进肿瘤细胞增殖和迁移。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常SMPDL3B蛋白的功能,影响细胞信号通路。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0008081 • GO:0006629
• GO:0005886

相关通路

Sphingolipid metabolism
Metabolism

蛋白质功能简介

SMPDL3B蛋白属于酸性鞘磷脂酶家族,但缺乏催化活性。它可能作为支架蛋白参与脂质信号传导,调节细胞增殖、分化和凋亡。在肾脏中,SMPDL3B对维持足细胞功能至关重要,其下调可导致足细胞损伤和蛋白尿。在癌症中,SMPDL3B可能通过影响脂质代谢促进肿瘤进展。

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