SMU1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SMU1是pre-mRNA剪接和DNA损伤反应的关键调控因子,其功能异常与多种癌症和发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SMU1 |
|---|---|
| 基因全名 | SMU1 homolog, splicing factor |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9p21.1 |
| NCBI Gene ID | 55234 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55234 |
| Ensembl ID | ENSG00000107175 |
| UniProt ID | Q2TAY7 |
| OMIM ID | 617099 |
| HGNC ID | 25438 |
| 基因别名 | SMU1, FLJ10829, MGC131851 |
基因功能与研究简介
SMU1基因编码一个参与pre-mRNA剪接的蛋白,是剪接体B复合物的组分。SMU1在DNA损伤反应中也发挥作用,通过与剪接因子和DNA损伤检查点蛋白相互作用,调控基因表达和基因组稳定性。SMU1的异常表达与多种癌症相关,可能作为潜在的预后标志物或治疗靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | SMU1在多种癌症中表达异常,可能通过影响剪接和DNA损伤反应促进肿瘤发生发展。 | 较强研究证据 |
| 发育障碍 | SMU1突变可能导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但致病性未明确 |
| c.456C>T (p.Arg152Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SMU1功能缺失可能导致剪接异常和DNA损伤修复缺陷,与疾病相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明SMU1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明SMU1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000398 (mRNA splicing | • via spliceosome) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005681 (spliceosomal complex) |
| • GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus) |
相关通路
• Spliceosome (hsa03040)
• DNA damage response (hsa03430)
蛋白质功能简介
SMU1蛋白是剪接体B复合物的组分,参与pre-mRNA剪接的催化步骤。它还与DNA损伤反应相关,可能通过调控剪接影响DNA修复基因的表达。SMU1在多种组织中表达,其异常与癌症和发育障碍相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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