SNAPC1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNAPC1是snRNA激活蛋白复合物的核心亚基,调控小核RNA转录,与神经发育和肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 SNAPC1
基因全名 small nuclear RNA activating complex polypeptide 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q22.3
NCBI Gene ID 6617 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6617
Ensembl ID ENSG00000100811
UniProt ID Q16533
OMIM ID 600591
HGNC ID 11139
基因别名 SNAP43; PTFgamma; SNAPc-43kDa

基因功能与研究简介

SNAPC1基因编码小核RNA(snRNA)激活蛋白复合物(SNAPc)的43 kDa亚基。SNAPc是RNA聚合酶II和III转录snRNA基因所必需的多亚基复合物,包括U1、U2、U4、U5 snRNA以及U6 snRNA等。SNAPC1作为核心亚基,参与复合物的组装和DNA结合,对snRNA基因的转录调控至关重要。该基因的突变或表达异常可能影响snRNA的合成,进而干扰RNA剪接等过程,与神经发育异常和肿瘤发生相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SNAPC1突变可能导致snRNA转录异常,影响神经发育相关基因的剪接,但具体机制尚在研究中。 暂无明确证据,但基于功能研究推测
癌症 SNAPC1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响snRNA合成和剪接促进肿瘤发生发展。 有研究报道,但证据等级中等

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.472C>T (p.Arg158Ter) 无义突变 罕见 可能导致截短蛋白,功能丧失
c.1045A>G (p.Thr349Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或相互作用
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变导致截短蛋白,可能破坏SNAPc复合物功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000978 • GO:0000994
• GO:0005634 • GO:0005667
• GO:0006367

相关通路

snRNA transcription
RNA polymerase III transcription

蛋白质功能简介

SNAPC1蛋白是SNAPc复合物的43 kDa亚基,包含一个SNAPc结构域,参与复合物的组装和DNA结合。该蛋白主要定位在细胞核,与SNAPC2、SNAPC3等亚基相互作用,共同识别snRNA基因启动子中的PSE元件,并招募RNA聚合酶II或III启动转录。SNAPC1的磷酸化可能调节其活性。

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