SNAPC2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNAPC2是snRNA激活蛋白复合物的小核RNA激活蛋白复合物亚基,参与小核RNA基因的转录调控,与神经发育和肿瘤发生相关。

基因信息卡

基因符号 SNAPC2
基因全名 small nuclear RNA activating complex polypeptide 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.3
NCBI Gene ID 6618 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6618
Ensembl ID ENSG00000104884
UniProt ID Q13487
OMIM ID 602777
HGNC ID 11138
基因别名 SNAP190, snRNA-activating protein complex subunit 2

基因功能与研究简介

SNAPC2(small nuclear RNA activating complex polypeptide 2)编码小核RNA激活蛋白复合物的190 kDa亚基,该复合物是RNA聚合酶II和III转录小核RNA基因所必需的多亚基因子。SNAPC2参与snRNA基因的启动子识别和转录激活,对细胞增殖和分化具有重要调控作用。研究表明SNAPC2在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响snRNA转录参与肿瘤发生。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SNAPC2突变可能导致snRNA转录异常,影响神经发育相关基因的表达,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
癌症 SNAPC2在多种肿瘤中表达上调,可能通过促进snRNA转录和核糖体生物发生促进肿瘤细胞增殖。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或复合物组装,功能影响未知
c.567del (p.Gln189fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能破坏SNAPC2功能,影响snRNA转录。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005667 transcription factor complex • GO:0006367 transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• GO:0000993 RNA polymerase III general transcription initiation factor activity

相关通路

snRNA transcription
RNA polymerase III transcription

蛋白质功能简介

SNAPC2蛋白是snRNA激活蛋白复合物的亚基,该复合物包含SNAPC1-5等亚基,通过结合snRNA基因启动子的PSE和DSE元件,招募RNA聚合酶II或III启动转录。SNAPC2在复合物中可能起到结构支撑作用,其表达水平影响snRNA合成,进而影响mRNA剪接和核糖体生物发生。

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