SNAPC3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNAPC3是snRNA激活蛋白复合物的重要亚基,参与小核RNA转录调控,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 SNAPC3
基因全名 small nuclear RNA activating complex polypeptide 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 9p22.3
NCBI Gene ID 6619 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6619
Ensembl ID ENSG00000164985
UniProt ID Q92966
OMIM ID 600591
HGNC ID 11138
基因别名 SNAP50

基因功能与研究简介

SNAPC3(small nuclear RNA activating complex polypeptide 3)编码snRNA激活蛋白复合物(SNAPc)的50 kDa亚基。SNAPc是RNA聚合酶II和III转录小核RNA(snRNA)基因所必需的多蛋白复合物。SNAPC3通过其组蛋白折叠结构域与SNAP190和SNAP43相互作用,参与启动子识别和转录起始。该基因突变可能导致神经发育障碍,如智力障碍和发育迟缓。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 SNAPC3基因突变导致snRNA转录异常,影响神经元基因表达,与智力障碍和发育迟缓相关。 ClinVar有致病性变异记录
癌症 暂无明确证据 暂无可靠数据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.472C>T (p.Arg158Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.626A>G (p.Tyr209Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):无义突变导致截短蛋白,可能被无义介导的mRNA降解,导致SNAPC3功能缺失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明SNAPC3突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):部分错义突变可能干扰SNAPc复合物组装,产生显性负性效应,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005669 (transcription factor TFIID complex) • GO:0006367 (transcription initiation from RNA polymerase II promoter)
• GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding)

相关通路

snRNA transcription (Reactome: R-HSA-6804756)
RNA polymerase II transcription initiation (KEGG: hsa03022)

蛋白质功能简介

SNAPC3蛋白是snRNA激活蛋白复合物(SNAPc)的50 kDa亚基,包含组蛋白折叠结构域,参与SNAPc复合物的组装和DNA结合。该蛋白在snRNA基因的转录调控中起关键作用,影响RNA聚合酶II和III的转录起始。

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