SNRNP200基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNRNP200是剪接体核心RNA解旋酶,其突变导致视网膜色素变性,是遗传性眼病的重要致病基因。

基因信息卡

基因符号 SNRNP200
基因全名 Small Nuclear Ribonucleoprotein U5 Subunit 200
基因类型 protein-coding
染色体位置 2q11.2
NCBI Gene ID 23020 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23020
Ensembl ID ENSG00000144028
UniProt ID O75643
OMIM ID 601664
HGNC ID 30848
基因别名 ASCC3L1, DKFZp686B02103, FLJ10335, KIAA0788, RP33, U5-200KD

基因功能与研究简介

SNRNP200基因编码U5 snRNP的200 kDa亚基,是剪接体复合物的核心RNA解旋酶,属于DExD/H-box蛋白家族。该蛋白在pre-mRNA剪接过程中催化U4/U6 snRNA解旋,是剪接体激活的关键步骤。SNRNP200突变与常染色体显性遗传视网膜色素变性(adRP)相关,其致病机制涉及剪接体功能异常导致视网膜细胞凋亡。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
视网膜色素变性 SNRNP200突变导致剪接体组装或解旋功能异常,影响视网膜细胞中特定基因的剪接,最终导致感光细胞凋亡。 已明确致病
常染色体显性遗传视网膜色素变性 SNRNP200基因突变是adRP的已知病因之一,多个突变位点已被证实。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
视网膜 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2041C>T (p.Arg681Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与视网膜色素变性相关
c.3260G>A (p.Arg1087Gln) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与视网膜色素变性相关
c.3260G>T (p.Arg1087Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与视网膜色素变性相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

部分突变可能导致蛋白功能丧失或剪接体活性降低,但SNRNP200单倍剂量不足可能不足以致病,可能通过显性负效应发挥作用。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明SNRNP200突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

多数致病突变可能通过显性负效应干扰剪接体功能,导致剪接异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003724 RNA helicase activity • GO:0005687 U4/U6 snRNP
• GO:0005689 U12-type spliceosomal complex • GO:0006397 mRNA processing
• GO:0008380 RNA splicing • GO:0000244 spliceosomal tri-snRNP complex assembly

相关通路

Spliceosome (hsa03040)

蛋白质功能简介

SNRNP200蛋白是U5 snRNP的核心成分,具有ATP依赖的RNA解旋酶活性,在剪接体激活过程中催化U4/U6 snRNA解旋,促进催化活性构象的形成。该蛋白在细胞核内广泛表达,对pre-mRNA剪接至关重要。其突变导致剪接体功能异常,进而影响视网膜细胞中特定基因的剪接,最终导致视网膜色素变性。

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