SNRPB基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNRPB编码核心剪接体蛋白SmB/B',参与前体mRNA剪接,其突变与脑干发育异常和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SNRPB
基因全名 Small Nuclear Ribonucleoprotein Polypeptides B and B1
基因类型 protein-coding
染色体位置 20p13
NCBI Gene ID 6628 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6628
Ensembl ID ENSG00000125826
UniProt ID P14678
OMIM ID 182282
HGNC ID 11153
基因别名 SmB, SmB', SmB/B', snRNP-B, CCMS, COD, MDS, SNRPB1

基因功能与研究简介

SNRPB基因编码核心剪接体蛋白SmB/B',是U1、U2、U4/U6和U5 snRNP复合物的组成部分,参与前体mRNA剪接。该蛋白在RNA代谢中发挥关键作用,其突变可导致脑干发育异常(如Cerebrocostomandibular syndrome)并与多种癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
脑肋下颌综合征 致病性突变导致剪接体功能异常,影响神经嵴细胞发育,导致骨骼和颅面畸形。 已明确致病(OMIM)
骨髓增生异常综合征 体细胞突变可能影响造血干细胞功能,与疾病发生相关。 具有较强研究证据(COSMIC)
胶质母细胞瘤 SNRPB高表达与肿瘤进展相关,可能通过调控剪接促进癌细胞增殖。 潜在关联(COSMIC)
乳腺癌 SNRPB表达异常与乳腺癌预后相关,可能参与肿瘤发生。 潜在关联(COSMIC)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.3G>A (p.Met1Ile) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.502C>T (p.Arg168Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
c.574A>G (p.Arg192Gly) 错义突变 罕见 可能影响蛋白与RNA结合,导致剪接异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致蛋白功能丧失或显著降低,如无义突变或移码突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

导致蛋白获得新功能或活性增强,目前SNRPB未见明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

突变蛋白干扰正常蛋白功能,如显性负性效应,目前SNRPB未见明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• RNA binding (GO:0003723) • mRNA splicing
• via spliceosome (GO:0000398) • spliceosomal snRNP complex (GO:0005681)
• nucleus (GO:0005634)

相关通路

Spliceosome (hsa03040)

蛋白质功能简介

SNRPB蛋白是剪接体核心组分,参与前体mRNA剪接。该蛋白包含Sm结构域,与Sm蛋白家族成员形成核心结构,参与snRNP组装。SNRPB在细胞核中定位,与多种RNA结合蛋白相互作用,调控基因表达。

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