SNRPC基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNRPC编码U1小核核糖核蛋白C亚基,是剪接体核心组分,参与前体mRNA剪接,其突变与脊髓性肌萎缩症等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SNRPC
基因全名 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C
基因类型 protein-coding
染色体位置 6p21.31
NCBI Gene ID 6631 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6631
Ensembl ID ENSG00000124562
UniProt ID P09234
OMIM ID 603522
HGNC ID 11161
基因别名 U1C, YU1C, U1-C, U1 snRNP C

基因功能与研究简介

SNRPC基因编码U1小核核糖核蛋白(U1 snRNP)的C亚基,该蛋白是剪接体U1 snRNP复合物的核心组分,参与前体mRNA的5'剪接位点识别和剪接体的组装。SNRPC蛋白包含一个锌指结构域和一个C端结构域,通过蛋白-蛋白相互作用与U1 snRNP的70K和A蛋白结合,稳定U1 snRNP与5'剪接位点的结合。SNRPC在RNA剪接中发挥关键作用,其功能异常可能导致剪接缺陷,进而引发多种疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
脊髓性肌萎缩症(Spinal Muscular Atrophy, SMA) SNRPC基因突变可能导致U1 snRNP功能异常,影响SMN2基因的剪接,导致SMN蛋白水平下降,从而引发SMA。但SNRPC突变在SMA中的直接致病证据尚不充分,多为研究性关联。 研究证据(PMID: 29309648)
癌症 SNRPC在多种癌症中表达异常,可能通过影响剪接调控参与肿瘤发生发展。例如,在肺癌、乳腺癌中SNRPC表达上调,与不良预后相关。但具体机制尚在研究中。 研究证据(PMID: 31530933)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
甲状腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾上腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.214C>T (p.Arg72Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常,但致病性未明确
c.1A>G (p.Met1?) 起始密码子突变 罕见 可能导致蛋白翻译起始失败,产生截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致SNRPC蛋白表达减少或功能缺失,可能影响U1 snRNP的组装和剪接功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明SNRPC存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:可能通过干扰U1 snRNP复合物的正常组装,产生显性负性效应,但具体证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000398 mRNA splicing • via spliceosome
• GO:0005681 spliceosomal complex • GO:0003723 RNA binding
• GO:0005515 protein binding

相关通路

hsa03040 Spliceosome (KEGG)

蛋白质功能简介

SNRPC蛋白(UniProt P09234)是U1 snRNP复合物的C亚基,分子量约17.4 kDa。该蛋白包含一个N端锌指结构域(Cys4型)和一个C端富含脯氨酸的区域。锌指结构域参与RNA结合和蛋白-蛋白相互作用,C端区域与U1 snRNP的70K和A蛋白相互作用。SNRPC在剪接体组装中至关重要,它稳定U1 snRNP与5'剪接位点的结合,并促进剪接体的早期组装。此外,SNRPC可能参与其他RNA加工过程,如多聚腺苷酸化。

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