SNRPD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNRPD1编码Sm D1蛋白,是剪接体核心组分,参与前体mRNA剪接,其突变与自身免疫性疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SNRPD1
基因全名 Small Nuclear Ribonucleoprotein D1 Polypeptide
基因类型 protein-coding
染色体位置 18q11.2
NCBI Gene ID 6632 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6632
Ensembl ID ENSG00000167088
UniProt ID P62314
OMIM ID 601063
HGNC ID 11159
基因别名 Sm-D1; SMD1; snRNP core protein D1

基因功能与研究简介

SNRPD1基因编码Sm D1蛋白,是U1、U2、U4/U6和U5 snRNP的核心组分,参与前体mRNA剪接。该蛋白在剪接体组装中发挥关键作用,并参与RNA加工。SNRPD1的突变或异常表达与多种疾病相关,包括自身免疫性疾病和癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
系统性红斑狼疮 SNRPD1是自身抗原,其抗体是SLE的标志物之一。 已明确致病
混合性结缔组织病 抗U1 snRNP抗体靶向SNRPD1等蛋白,参与疾病发病。 已明确致病
癌症 SNRPD1在多种肿瘤中表达异常,可能影响剪接调控,促进肿瘤发生发展。 具有较强研究证据
发育异常 SNRPD1功能缺失可能导致剪接异常,影响发育,但具体证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
甲状腺 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.79G>A (p.Gly27Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
c.97C>T (p.Arg33Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致蛋白功能丧失或降低,可能影响剪接体组装和功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005681 • GO:0005685
• GO:0006397 • GO:0008380
• GO:0003723 • GO:0005634

相关通路

hsa03040
R-HSA-72163
R-HSA-72165

蛋白质功能简介

SNRPD1蛋白是剪接体Sm核心蛋白的组成部分,与SmB/B'、SmD2、SmD3、SmE、SmF和SmG形成七聚体环,参与snRNP的组装。该蛋白在mRNA剪接中起关键作用,并可能参与其他RNA加工过程。其表达异常与自身免疫病和癌症相关。

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