SNRPD2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNRPD2编码Sm-D2蛋白,是剪接体核心组分,参与前体mRNA剪接,其突变与脊髓性肌萎缩症等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SNRPD2
基因全名 Small Nuclear Ribonucleoprotein D2 Polypeptide
基因类型 protein-coding
染色体位置 19q13.2
NCBI Gene ID 6633 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6633
Ensembl ID ENSG00000125743
UniProt ID P62316
OMIM ID 601061
HGNC ID 11160
基因别名 Sm-D2; SMD2; snRNP core protein D2

基因功能与研究简介

SNRPD2基因编码Sm-D2蛋白,是U1、U2、U4/U6和U5 snRNP的核心组分,参与前体mRNA剪接。该蛋白在剪接体组装和RNA剪接中发挥关键作用,其功能障碍可能导致剪接异常,进而引发多种疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
脊髓性肌萎缩症(Spinal Muscular Atrophy, SMA) SNRPD2突变可能导致剪接体功能异常,影响SMN2基因的剪接,从而与SMA的发病相关。 较强研究证据
癌症 SNRPD2在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响剪接调控肿瘤相关基因的表达,参与肿瘤发生发展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.79C>T (p.Arg27Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变或移码突变,导致蛋白功能缺失或减弱。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005681 • GO:0005685
• GO:0000398 • GO:0005634
• GO:0003723

相关通路

hsa03040
hsa03041

蛋白质功能简介

SNRPD2编码的Sm-D2蛋白是剪接体核心组分,属于Sm蛋白家族。该蛋白包含Sm结构域,参与snRNP的组装和稳定性。Sm-D2与Sm-D1、Sm-D3等形成异源寡聚体,是剪接体组装所必需的。其功能异常可能导致RNA剪接缺陷,进而影响基因表达调控。

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