SNRPD3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNRPD3编码SmD3蛋白,是剪接体核心组分,参与前体mRNA剪接,其突变与自身免疫性疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SNRPD3
基因全名 small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide
基因类型 protein-coding
染色体位置 22q11.23
NCBI Gene ID 6634 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6634
Ensembl ID ENSG00000100228
UniProt ID P62318
OMIM ID 601062
HGNC ID 11161
基因别名 Sm-D3; SMD3; snRNP core protein D3

基因功能与研究简介

SNRPD3基因编码SmD3蛋白,是U1、U2、U4/U6和U5 snRNP的核心组分,参与前体mRNA剪接。SmD3蛋白包含一个Sm结构域,与Sm蛋白家族成员相互作用形成核心颗粒。该基因突变可能导致剪接异常,与自身免疫性疾病和癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
系统性红斑狼疮 自身抗体靶向SmD3,导致免疫复合物沉积和组织损伤 已明确致病
混合性结缔组织病 抗U1 RNP抗体可能交叉识别SmD3,参与疾病发生 具有较强研究证据
多种癌症 SNRPD3表达异常或突变可能影响剪接,促进肿瘤发生发展 癌症相关
发育异常 SNRPD3突变可能导致剪接缺陷,影响胚胎发育 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
甲状腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.79G>A (p.Gly27Arg) 错义突变 罕见 可能影响Sm结构域,干扰蛋白相互作用
c.118C>T (p.Arg40Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致蛋白功能丧失或降低,可能影响剪接体组装和功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000245 • GO:0005681
• GO:0005687 • GO:0006397
• GO:0008380 • GO:0030532
• GO:0045296

相关通路

hsa03040
hsa03041

蛋白质功能简介

SNRPD3编码的SmD3蛋白是剪接体Sm核心蛋白之一,包含Sm结构域,参与U1、U2、U4/U6和U5 snRNP的组装。SmD3与SmB/B'、SmD1、SmD2、SmE、SmF和SmG形成七聚体环,是剪接体催化核心的组成部分。该蛋白在mRNA剪接中发挥关键作用,其异常可能导致剪接异常,进而影响基因表达和细胞功能。

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