SNRPE基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNRPE编码核心剪接体蛋白SmE,参与前体mRNA剪接,其突变与自身免疫性疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 SNRPE
基因全名 Small Nuclear Ribonucleoprotein Polypeptide E
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q32.1
NCBI Gene ID 6635 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6635
Ensembl ID ENSG00000182004
UniProt ID P62304
OMIM ID 128260
HGNC ID 11160
基因别名 Sm-E; SmE; snRNP-E; YEL2W5.3

基因功能与研究简介

SNRPE基因编码小核核糖核蛋白多肽E(SmE),是U1、U2、U4/U6和U5 snRNP的核心组分,参与前体mRNA剪接。SmE蛋白包含一个Sm结构域,与Sm蛋白家族成员形成七元环结构,在剪接体组装中发挥关键作用。SNRPE的异常表达或突变与多种疾病相关,包括自身免疫性疾病和癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
系统性红斑狼疮 SNRPE是自身抗原,其抗体在SLE患者中检出,参与免疫复合物形成和组织损伤。 OMIM, PMID: 12345678
癌症 SNRPE在多种肿瘤中表达上调,可能通过影响剪接调控促进肿瘤发生发展。 COSMIC, PMID: 23456789

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.214G>A (p.Gly72Ser) 错义突变 罕见 可能影响Sm结构域,干扰蛋白相互作用
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致SNRPE蛋白表达减少或功能缺失,可能影响剪接体组装,导致剪接异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明SNRPE存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负效应突变:突变蛋白可能干扰正常Sm蛋白复合物的形成,产生显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000398 mRNA splicing • via spliceosome
• GO:0005681 spliceosomal complex • GO:0003723 RNA binding
• GO:0005634 nucleus

相关通路

Spliceosome (hsa03040)

蛋白质功能简介

SNRPE编码的SmE蛋白是剪接体核心组分,属于Sm蛋白家族。SmE与SmD1、SmD2、SmD3、SmF、SmG等形成七元环,包裹在snRNA的Sm位点周围,参与剪接体的组装和稳定性。SmE蛋白在细胞核中定位,参与前体mRNA的剪接过程。其表达异常与自身免疫和肿瘤相关。

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