SNRPF基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNRPF编码SmF蛋白,是剪接体核心组分,参与前体mRNA剪接,其突变与脊髓性肌萎缩症等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SNRPF
基因全名 Small Nuclear Ribonucleoprotein Polypeptide F
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 12q23.3
NCBI Gene ID 6636 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6636
Ensembl ID ENSG00000139343
UniProt ID P62306
OMIM ID 603521
HGNC ID 11162
基因别名 SmF, snRNP-F, Sm-F

基因功能与研究简介

SNRPF基因编码小核核糖核蛋白多肽F(SmF),是U1、U2、U4/U6和U5 snRNP的核心组分,参与前体mRNA剪接。SmF蛋白与Sm蛋白家族成员形成七元环结构,在剪接体组装和剪接位点识别中发挥关键作用。SNRPF在多种组织中广泛表达,其功能异常与神经退行性疾病和癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
脊髓性肌萎缩症 SNRPF基因突变可能影响snRNP组装,导致剪接异常,与SMA的发病机制相关。 较强研究证据
癌症 SNRPF在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响剪接调控肿瘤发生发展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.3G>A (p.Met1Ile) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.214A>G (p.Thr72Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或相互作用
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致SNRPF蛋白表达减少或功能缺失,影响剪接体组装和mRNA剪接。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005681 (spliceosomal complex) • GO:0000245 (spliceosomal complex assembly)
• GO:0000398 (mRNA splicing • via spliceosome)
• GO:0003723 (RNA binding)

相关通路

hsa03040 (Spliceosome)
R-HSA-72163 (mRNA Splicing - Major Pathway)

蛋白质功能简介

SNRPF编码的SmF蛋白是剪接体核心组分,属于Sm蛋白家族。SmF与SmB/B'、SmD1、SmD2、SmD3、SmE和SmG共同组装成七元环,包裹snRNA的Sm位点,参与snRNP的生物发生和剪接体组装。SmF蛋白含有Sm基序,介导蛋白-蛋白和蛋白-RNA相互作用。

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