SNW1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNW1是剪接体和转录调控的关键因子,参与DNA损伤应答,与多种癌症和发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 SNW1
基因全名 SNW domain containing 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q31.3
NCBI Gene ID 22938 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22938
Ensembl ID ENSG00000100603
UniProt ID Q13573
OMIM ID 603055
HGNC ID 11171
基因别名 SKIP, SNW1, NCOA-62, Prp45

基因功能与研究简介

SNW1基因编码一个含有SNW结构域的核蛋白,是剪接体U5 snRNP的组分,参与pre-mRNA剪接。同时,SNW1作为转录共调节因子,与多种转录因子(如核受体、p53等)相互作用,调节基因表达。SNW1还参与DNA损伤应答和细胞周期调控。研究表明,SNW1在多种癌症中表达异常,可能影响肿瘤发生发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SNW1在多种癌症中表达上调,可能通过调控剪接和转录促进肿瘤增殖和转移。 较强研究证据
发育异常 SNW1功能缺失可能导致胚胎发育异常,但具体机制尚不明确。 潜在关联
暂无明确疾病 目前尚无SNW1直接致病的单基因遗传病报道。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但临床意义未明
c.456C>T (p.Ser152Leu) 错义突变 罕见 可能影响剪接体功能,但证据不足
c.789del (p.Lys263fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响剪接体功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无明确证据表明SNW1存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前尚无明确证据表明SNW1存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000398 (mRNA splicing • via spliceosome)
• GO:0003713 (transcription coactivator activity) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0005681 (spliceosomal complex) • GO:0006974 (DNA damage response)

相关通路

hsa03040 (Spliceosome)
hsa04110 (Cell cycle)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

SNW1蛋白(UniProt Q13573)含有SNW结构域,是剪接体U5 snRNP的组分。它参与pre-mRNA剪接,并作为转录共调节因子与多种转录因子相互作用。SNW1在DNA损伤应答中发挥作用,可能通过调节p53活性影响细胞周期和凋亡。

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