SNX13基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNX13(Sorting Nexin 13)是内体分选和信号转导的关键调控因子,与心脏发育和多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SNX13
基因全名 Sorting Nexin 13
基因类型 protein-coding
染色体位置 7p21.3
NCBI Gene ID 11259 ncbi.nlm.nih.gov/gene/11259
Ensembl ID ENSG00000105928
UniProt ID Q9Y2W1
OMIM ID 606592
HGNC ID 15976
基因别名 RGS-PX1, MGC111342

基因功能与研究简介

SNX13(Sorting Nexin 13)基因编码分选连接蛋白家族成员,该蛋白包含PX结构域和RGS结构域,参与内体分选、细胞信号转导及G蛋白偶联受体的调控。SNX13在心脏发育中发挥重要作用,其突变与先天性心脏病相关。此外,SNX13可能参与肿瘤发生和神经发育过程。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
先天性心脏病 SNX13突变导致蛋白功能异常,影响心脏发育相关信号通路,如Wnt和G蛋白信号,已明确致病。 ClinVar, OMIM
扩张型心肌病 SNX13表达异常与心肌重构相关,具有较强研究证据。 PubMed
肿瘤 SNX13在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控内体分选影响细胞增殖和凋亡,潜在关联。 COSMIC, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
心脏 暂无可靠数据 高表达(根据GTEx)
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
H9c2(大鼠心肌细胞) 暂无可靠数据 内源性表达
HEK293 暂无可靠数据 常用于过表达研究
HeLa 暂无可靠数据 内源性表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.567_568insA (p.Gln190ThrfsTer5) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.890A>G (p.Glu297Gly) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响待验证
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致蛋白表达减少或功能缺失,与先天性心脏病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005768 (endosome) • GO:0006886 (intracellular protein transport)
• GO:0007165 (signal transduction) • GO:0005096 (GTPase activator activity)

相关通路

Endosomal sorting pathway
G protein signaling pathway

蛋白质功能简介

SNX13蛋白包含PX结构域,可结合磷脂酰肌醇,参与内体分选;其RGS结构域具有GTPase激活蛋白(GAP)活性,调节G蛋白信号。SNX13在心脏发育中通过调控Wnt信号和G蛋白偶联受体信号影响心肌细胞增殖和分化。

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