SNX14基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
SNX14编码分选连接蛋白14,参与内体分选和脂质代谢,其突变与常染色体隐性小脑性共济失调相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SNX14 |
|---|---|
| 基因全名 | sorting nexin 14 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 6q14.3 |
| NCBI Gene ID | 57231 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57231 |
| Ensembl ID | ENSG00000112419 |
| UniProt ID | Q9Y5W7 |
| OMIM ID | 616105 |
| HGNC ID | 14976 |
| 基因别名 | FLJ10895, MGC126851, MGC126853 |
基因功能与研究简介
SNX14基因编码分选连接蛋白14(Sorting nexin-14),属于分选连接蛋白家族,含有PX结构域,参与细胞内吞分选和脂质代谢。SNX14主要定位于内体,调控内体-高尔基体运输。SNX14突变可导致常染色体隐性小脑性共济失调(SCAR20),表现为小脑萎缩和运动障碍。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 常染色体隐性小脑性共济失调20型 | SNX14纯合或复合杂合突变导致蛋白功能丧失,影响内体分选和脂质代谢,导致小脑浦肯野细胞变性 | 已明确致病 |
| 小脑性共济失调 | SNX14突变导致小脑发育异常和功能障碍 | 具有较强研究证据 |
| 痉挛性截瘫 | 部分SNX14突变患者表现为痉挛性截瘫 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 小脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 大脑皮层 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1262T>C (p.Leu421Pro) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能丧失 |
| c.1753C>T (p.Arg585*) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.2146_2147del (p.Leu716Valfs*3) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
SNX14突变导致蛋白功能丧失,影响内体分选和脂质代谢,是疾病的主要机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005768 endosome |
| • GO:0005794 Golgi apparatus | • GO:0006886 intracellular protein transport |
| • GO:0006644 phospholipid metabolic process |
相关通路
• Endosomal sorting complex required for transport (ESCRT)
• Phospholipid metabolism
蛋白质功能简介
SNX14蛋白由965个氨基酸组成,含有PX结构域,能够结合磷脂酰肌醇,参与内体分选。SNX14定位于早期内体,调控内体到高尔基体的运输,并参与脂质代谢。SNX14功能缺失导致小脑神经元脂质代谢异常和细胞死亡。