SNX18基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNX18编码分选连接蛋白18,参与内体运输和自噬,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SNX18
基因全名 Sorting Nexin 18
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q23.2
NCBI Gene ID 112574 ncbi.nlm.nih.gov/gene/112574
Ensembl ID ENSG00000113520
UniProt ID Q96RF0
OMIM ID 615906
HGNC ID 19275
基因别名 SH3PX2, SH3PXD3B, FLJ10878

基因功能与研究简介

SNX18(Sorting Nexin 18)基因编码分选连接蛋白18,属于分选连接蛋白家族,含有PX结构域和SH3结构域。该蛋白参与内体运输、自噬和细胞信号传导等过程。SNX18在多种组织中表达,尤其在脑、肺和肾中表达较高。研究表明SNX18与多种疾病相关,包括癌症、神经退行性疾病和病毒感染。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SNX18在多种癌症中表达异常,可能通过调节内体运输和自噬影响肿瘤发生发展。 较强研究证据
神经退行性疾病 SNX18参与自噬过程,其功能异常可能与阿尔茨海默病等神经退行性疾病相关。 潜在关联
病毒感染 SNX18参与病毒颗粒的内体运输,可能影响病毒感染效率。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.456C>T (p.R152W) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致SNX18蛋白活性降低或丧失,影响内体运输和自噬过程。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强SNX18的活性,但目前在SNX18中尚无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常SNX18功能,但目前在SNX18中尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005768 endosome
• GO:0005776 autophagosome • GO:0006886 intracellular protein transport
• GO:0016192 vesicle-mediated transport

相关通路

Endocytosis
Autophagy

蛋白质功能简介

SNX18蛋白包含PX结构域和SH3结构域,PX结构域介导与磷脂酰肌醇的结合,SH3结构域参与蛋白-蛋白相互作用。SNX18定位于内体和自噬体,参与内体分选和自噬体形成。研究表明SNX18与ATG9A相互作用,促进自噬体的形成。

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