SNX6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SNX6是分选连接蛋白家族成员,参与细胞内吞分选和信号转导,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 SNX6
基因全名 sorting nexin 6
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q13.1
NCBI Gene ID 58533 ncbi.nlm.nih.gov/gene/58533
Ensembl ID ENSG00000100823
UniProt ID Q9UNH7
OMIM ID 606377
HGNC ID 14972
基因别名 TRAF4-associated protein 1 (TRAF4AF1)

基因功能与研究简介

SNX6(sorting nexin 6)是分选连接蛋白(sorting nexin)家族成员,含有PX结构域,能够结合磷脂酰肌醇-3-磷酸(PI3P),参与细胞内吞分选、膜运输和信号转导。SNX6与TRAF4相互作用,可能参与TNF受体信号通路。研究表明SNX6在多种肿瘤中表达异常,与肿瘤发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 SNX6在多种癌症中表达异常,可能通过调节受体运输影响肿瘤进展,但具体机制尚不明确。 较强研究证据
神经系统疾病 SNX6参与神经元内吞分选,可能影响神经递质受体运输,与神经退行性疾病相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但致病性未明确
c.456C>T (p.S152F) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但致病性未明确
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致SNX6蛋白功能丧失或降低,可能影响细胞内吞分选和信号转导。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:导致SNX6蛋白获得新功能或活性增强,可能促进肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰正常SNX6功能,可能影响细胞信号通路。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005545 phosphatidylinositol binding
• GO:0005768 endosome • GO:0005794 Golgi apparatus
• GO:0006886 intracellular protein transport • GO:0015031 protein transport

相关通路

Endocytosis
Vesicle-mediated transport

蛋白质功能简介

SNX6蛋白属于分选连接蛋白家族,含有PX结构域,能够结合磷脂酰肌醇-3-磷酸(PI3P),定位于内体和高尔基体,参与细胞内吞分选和膜运输。SNX6与TRAF4相互作用,可能参与TNF受体信号通路。研究表明SNX6在多种肿瘤中表达异常,可能通过调节受体运输影响肿瘤进展。

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