SOD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

SOD1基因编码超氧化物歧化酶1,是抗氧化防御的关键酶,其突变与肌萎缩侧索硬化症(ALS)密切相关。

基因信息卡

基因符号 SOD1
基因全名 superoxide dismutase 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 21q22.11
NCBI Gene ID 6647 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6647
Ensembl ID ENSG00000142168
UniProt ID P00441
OMIM ID 147450
HGNC ID 11186
基因别名 ALS, ALS1, IPOA, SOD, hSod1, superoxide dismutase 1, soluble

基因功能与研究简介

SOD1基因编码超氧化物歧化酶1,这是一种在细胞质中发挥作用的抗氧化酶,催化超氧自由基转化为过氧化氢和氧气,从而保护细胞免受氧化损伤。SOD1在多种组织中广泛表达,尤其在运动神经元中高表达。SOD1基因突变是家族性肌萎缩侧索硬化症(ALS)的主要病因之一,目前已发现超过200种致病突变,这些突变通过获得毒性功能或丧失功能导致运动神经元死亡。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肌萎缩侧索硬化症(ALS) SOD1突变导致毒性功能获得,引起运动神经元退行性变 已明确致病
家族性肌萎缩侧索硬化症(FALS) SOD1突变是FALS的主要遗传原因,占FALS的20%左右 已明确致病
散发性肌萎缩侧索硬化症(SALS) SOD1突变在SALS中罕见,但部分病例可能携带低外显率突变 潜在关联
其他神经退行性疾病 SOD1突变可能与其他神经退行性疾病相关,但证据有限 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脊髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
大脑皮层 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
SH-SY5Y 暂无可靠数据 暂无可靠数据
NSC-34 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
p.A4V 错义突变 常见于北美人群,占FALS的50% 功能获得,毒性增强
p.H46R 错义突变 常见于日本人群 功能获得,毒性增强
p.G93A 错义突变 常见于转基因小鼠模型 功能获得,毒性增强
p.E100G 错义突变 罕见 功能获得,毒性增强
p.I113T 错义突变 罕见 功能获得,毒性增强
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

部分SOD1突变导致酶活性降低,但通常认为毒性功能获得是主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

大多数ALS相关SOD1突变通过获得毒性功能,如异常蛋白聚集、氧化应激增加、线粒体功能障碍等,导致运动神经元死亡。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

少数突变可能通过显性负效应干扰野生型SOD1的功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004784 superoxide dismutase activity • GO:0005515 protein binding
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0005829 cytosol
• GO:0005634 nucleus • GO:0005759 mitochondrion
• GO:0006801 superoxide metabolic process • GO:0006979 response to oxidative stress

相关通路

hsa04115 p53 signaling pathway
hsa04210 Apoptosis
hsa05014 Amyotrophic lateral sclerosis
hsa04064 NF-kappa B signaling pathway

蛋白质功能简介

SOD1蛋白由153个氨基酸组成,分子量约16 kDa,以同源二聚体形式存在,每个亚基含有一个铜离子和一个锌离子。SOD1主要定位于细胞质,也存在于线粒体膜间隙和细胞核。其功能是催化超氧自由基歧化为过氧化氢和氧气,保护细胞免受氧化损伤。SOD1突变导致蛋白错误折叠和聚集,形成毒性寡聚体,通过多种机制导致运动神经元死亡,包括氧化应激、线粒体功能障碍、轴突运输受损、神经炎症等。

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