SOHLH1基因|基因功能、疾病关联、突变与生殖发育研究
SOHLH1是调控精子发生和卵子发生的关键转录因子,其突变与男性不育和女性卵巢功能障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | SOHLH1 |
|---|---|
| 基因全名 | spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9q34.3 |
| NCBI Gene ID | 402381 ncbi.nlm.nih.gov/gene/402381 |
| Ensembl ID | ENSG00000165689 |
| UniProt ID | Q5JUK3 |
| OMIM ID | 610224 |
| HGNC ID | 27838 |
| 基因别名 | BHLHB5, bHLHe80, SOHLH1A |
基因功能与研究简介
SOHLH1(spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1)基因编码一个碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子,在生殖细胞发育中发挥关键作用。该蛋白主要在睾丸和卵巢中表达,调控精子发生和卵子发生过程中的基因表达。SOHLH1对于原始生殖细胞的分化和成熟至关重要,其功能缺失会导致生殖障碍。研究表明,SOHLH1突变与非梗阻性无精子症(NOA)和卵巢功能障碍相关,但具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 非梗阻性无精子症 | SOHLH1突变导致蛋白功能丧失,影响精子发生,导致无精子症。 | ClinVar, 文献报道 |
| 卵巢功能障碍 | SOHLH1突变可能影响卵子发生,导致卵巢功能不全或早衰。 | ClinVar, 文献报道 |
| 男性不育 | SOHLH1突变与男性不育相关,表现为无精子症或严重少精子症。 | ClinVar, 文献报道 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 精原细胞 | 暂无可靠数据 | 关键表达 |
| 卵母细胞 | 暂无可靠数据 | 关键表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.346C>T (p.Arg116Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.424A>G (p.Thr142Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.577G>A (p.Gly193Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响DNA结合 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失):突变导致蛋白功能缺失,如无义突变产生截短蛋白,影响转录调控,导致生殖细胞发育障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明SOHLH1突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负效应):目前暂无明确证据表明SOHLH1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding) | • GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity |
| • RNA polymerase II-specific) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0007275 (multicellular organism development) | • GO:0007283 (spermatogenesis) |
| • GO:0007292 (female gamete generation) | • GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II) |
相关通路
• 暂无明确Pathway ID,但SOHLH1参与生殖细胞发育的转录调控网络。
蛋白质功能简介
SOHLH1蛋白属于bHLH转录因子家族,包含一个基本的DNA结合结构域和一个螺旋-环-螺旋二聚化结构域。它通过与E-box序列结合,调控下游靶基因的表达,从而影响生殖细胞的增殖和分化。SOHLH1在睾丸精原细胞和卵巢卵母细胞中特异性表达,是生殖细胞发育的关键调控因子。